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苍白杆菌产生脂肽的结构解析

2013-09-12程斌斌杨世忠牟伯中

微生物学杂志 2013年3期

程斌斌,杨世忠,牟伯中

(华东理工大学化学系,上海 200237)

生物表面活性剂是一类由微生物代谢产生的表面活性物质,其结构同时具有亲水性和疏水性,具有很高的表面活性和生物活性[1]。生物表面活性剂不仅具有优良的表界面活性、化学稳定性和热稳定性,还具有抗菌、抗病毒、环境友好可降解等特性。生物表面活性剂已经在3次采油(MEOR)、化妆品和环境修复领域开始应用,同时在食物、医药领域具有广阔的应用前景。脂肽是一种重要的生物表面活性剂,主要来源于芽胞杆菌、假单胞菌、曲霉菌、链霉菌、沙雷氏菌属和游动放线菌的菌属等。表面活性素(Surfactin)是一类典型的脂肽表面活性剂,其结构是由β-羟基脂肪酸和7个氨基酸组成的环状脂肽组成。脂肽在酸性条件下高温密封水解成游离的β-羟基脂肪酸和氨基酸后,甲酯化后通过气质联用(GC-MS)分析脂肪酸组成[2];硅烷化后通过GC-MS分析氨基酸组成[3]。近年来,串联质谱技术(MS/MS)的发展,为分析脂肽中氨基酸以及氨基酸的连接顺序带来了极大的便利[4]。本文从油藏产出液中分离出1株能代谢产生脂肽的细菌,通过16S rDNA的方法鉴定为苍白杆菌(Ochrobactrum sp.)。这是首次发现苍白杆菌也能够代谢产生脂肽。通过GC-MS分析了脂肽中脂肪酸和氨基酸的组成,并结合MS/MS进一步分析了肽环氨基酸的连接顺序。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 培养基 KH2PO43.0 g,Na2HPO4·12H2O 25.2 g,NH4NO32.0 g,MgSO40.1 g,CaCl220 μmol/L,MnSO430 μmol/L,蔗糖 20.0 g,酵母粉0.5 g,加去离子水配成1 L溶液。

1.1.2 主要仪器和试剂 主要仪器:气质联用仪6890GC-7895MS(Agilent,USA),四级杆-飞行时间串联质谱(Q-Tof Micro,UK);主要试剂:N,O-双(三甲基硅基)三氟乙酰胺(BSTFA)(Sigma-Aldrich,USA)、甲醇、硫酸、盐酸、无水乙醚等试剂均为国产且纯度为AR。……

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