耿立英，王秀秀，王秋悦，潘素敏，朱文进，张传生，尹春光

(1河北科技师范学院，河北秦皇岛，066600;2济宁学院)

畜禽品种的形成受到自然选择和人工选择共同作用，而种群在短期内受到特异高强度正选择作用，导致其基因组发生选择性清扫现象，使某些优势基因可在种群中相对较快地扩散，进而引起种群分化，形成生产性能和生产方向不同的品种或品系。因此，鉴定分析不同品种间特异的选择性清除基因、标记［1，2］，可为揭示不同品种的表型差异的分子机理提供线索。

近期，Carl-Johan Rubin等［3］采用重测序技术在鸡基因组中发现了多个选择性清除(selective sweep)区域，其中就包括SH3RF2基因(SH3 domain containing ring finger 2)的插入/缺失位点。研究证实，SH3RF2基因在鸡的大脑和肌肉中表达，其插入/缺失突变是与体重相关的原因突变，固定于肉鸡的高长系中(HW)，而在低长系中(LW)和商品肉鸡中(Broiler)以较低的频率存在;还发现，该缺失与肉鸡的生长与体重存在的密切的正相关。赵妤娟等［4］对SH3RF2基因的插入/缺失突变在15个中国地方鸡种的频率分布进行了研究，结果所检测地方鸡种均是非缺失的纯合子，没有发现缺失等位基因。除此之外，对SH3RF2基因其他信息尚缺乏深入了解。

鸡是一种重要的经济动物和模式生物，目前其全基因组测序工作的已经完成。在鸡后基因组时代，利用生物信息技术对其功能进行解读和研究已经引起国内外学者的重视，也已经取得诸多重要的研究成果［5，6］。这对鸡的SH3RF2生物信息分析提供了值得借鉴的方法和思路。……