实时荧光定量PCR方法检测非霍奇金淋巴瘤患者B淋巴细胞刺激因子表达水平①
2012-06-21王金湖杨剑虹王旭东申娴娟鞠少卿
王金湖 王 梅 杨剑虹 王旭东 申娴娟 浦 江 鞠少卿
(江苏省太仓市第一人民医院检验科,太仓 215400)
B淋巴细胞刺激因子(BAFF)是1999年发现的TNF超家族的成员之一[1],BAFF具有特异性激活B淋巴细胞,促进B细胞增殖等功能。但新近研究发现BAFF过量表达会导致一些恶性肿瘤的发生,包括非霍奇金淋巴瘤(NHL)。因此我们利用LightCycler实时荧光定量PCR仪建立定量检测BAFFmRNA的方法,测定人NHL外周血中BAFF mRNA含量,探讨BAFF基因表达水平与NHL的相关性。
1 材料与方法
1.1 试剂与耗材
1.1.1 标本来源 20名健康献血者,来自本院体检中心体检健康者,其中女性13例,男性7例,年龄18~42岁,平均(25±7)岁。47例NHL患者,2007年8月~2008年8月来本院和南通大学附属医院的住院患者,其中男性27例,女性20例,年龄32~83岁,平均年龄(60±7)岁。
1.1.2 主要试剂与仪器 SuperScriptTMⅢ逆转录试剂盒(美国Fermentas公司);pGEM-T easy载体、质粒提取试剂盒、IPTG、dNTPS等(美国 Promega公司);胶回收试剂盒(上海华舜生物工程公司)。PTC-200 PCR扩增仪(美国MJ公司);LightCycler定量PCR扩增仪(德国Roche公司);U-0080D核酸紫外检测日本Hitachi公司);Dolphin-Doc凝胶成像系统(美国WEALTEC公司)。
1.2 实验方法
1.2.1 外周血中单个核细胞的分离 无菌采取新鲜血液3 ml,用EDTA抗凝。取淋巴细胞分离液(按与血液1∶2的比例),加入到15 ml锥形离心管中,再将血液沿管壁轻轻铺到分离液上面,2 000 r/min离心20分钟,取血浆层与分层液交界处浑浊的灰白层(富含单个核细胞),用生理盐水洗涤2次,1 500 r/min离心10分钟,最后弃去上清,-80℃冰箱保存。
1.2.2 引物设计 引物设计根据BAFF(注册号为AY129225)和内参GAPDH(注册号为NC_000012.10)全序列,应用 Beacon Designer 2.1软件,设计引物,由上海生工生物工程公司合成。BAFF-s 5'-CACGCCTTACTTCTTGCC-3',BAFF-as 5'-CTTGGAGGATCGGACAG-3',产物长度 102 bp;GAPDH-s 5'-CGGAGTCAACGGATTGGTCGTAT-3',GAPDH-as 5'-AGCCTTCTCCATGGTGGTGAAGAC-3',产物长度193 bp。
1.2.3 RNA的抽提与逆转录聚合酶反应(RTPCR)Trizol法提取细胞总RNA,核酸蛋白紫外分析仪检测RNA质量和浓度。……
