王秀秀，陈纪新，黄邦钦

（福建省陆海界面生态环境重点实验室，厦门大学 环境与生态学院，福建 厦门 361005）

0 引言

随着藻类全基因组测序物种的增多，赤潮藻蛋白质组学的发展也更加蓬勃［1－2］。蛋白质双向电泳样品提取方法是蛋白质组学研究的重要内容之一，但由于不同藻类细胞内生化组成的差别较大，故已经广泛应用的植物蛋白提取方法并不适用于藻类［3－4］，而目前尚没有一种通用的藻类蛋白提取方法，针对于每一种藻的蛋白提取方法都需优化［5］。蛋白的提取是蛋白质组学的关键步骤，但在不同的物种中的蛋白提取最适方法差异很大，如铜绿微囊藻Microcystisaeruginosa的最适提取条件为Triton X－100提取法［6］，亚历山大藻Alexandriumsp.的最适提取法为Triton X－100－尿素提取法［7］，无菌塔玛亚历山大藻Alexandriumtamarense的最适藻类蛋白提取条件为裂解液法［8］。CHAN et al［9］认为，直接 TCA－丙酮沉淀法的效果与Tris缓冲液提取法的效果相当，但都比裂解液提取法的效果要好。原雅纬 等［8］则认为，裂解液结合TCA－丙酮沉淀法比直接TCA－丙酮沉淀法提取蛋白得到的双向电泳图谱要好。

中肋骨条藻Skeletonemacostatum是一种世界性的在沿海和海洋水域起着重要生态作用的物种，它能支持较高初级生产力，是我国长江口赤潮高发区的常见肇事种［10－12］，但这一物种的双向电泳样品制备方法目前尚未见报道。裂解液法和直接三氯乙酸（TCA）－丙酮沉淀法是广泛使用的藻细胞蛋白提取方法，本文比较了这两种方法提取中肋骨条藻的双向电泳结果，并优化了这一物种的蛋白制备最适条件，为后续的进一步研究提供科学依据。……