日本血吸虫可溶性抗原基因的生物信息学分析
2012-03-31卢利莎倪凤娥
长江大学学报(自科版) 2012年12期
关键词:生物
熊 涛,张 枫,卢利莎,倪凤娥
(长江大学生命科学学院,湖北 荆州 434025)
日本血吸虫可溶性抗原基因的生物信息学分析
熊 涛,张 枫,卢利莎,倪凤娥
(长江大学生命科学学院,湖北 荆州 434025)
应用国际互联网生物信息学网站,分析整理了日本血吸虫(Schistosomasisjaponicum)抗原基因编码的蛋白质序列。结果表明,在15个日本血吸虫抗原基因编码的蛋白中,等电点最高的是AF500622,最低的是AM26213;亲水性最高的是AF370036,最低的是AF50062。对日本血吸虫抗原基因编码的蛋白质进行生物信息学的整理分类,为进行抗原提取和可溶性研究奠定了基础。
日本血吸虫(Schistosomasisjaponicum);生物信息学;基因;序列分析
日本血吸虫(Schistosomasisjaponicum)是一种复杂的多细胞生物,近年来在我国局部地区对人类的健康造成了一定的威胁[1]。日本血吸虫病对宿主的最大危害是来自虫卵所致的肉芽病变。日本血吸虫成虫约24d开始产卵,约4周时肝组织内发现虫卵,5周尚未形成虫卵病变,至6周时发生严重病变时即进行诊断[2]。随着生物技术和互联网的发展,积累了大量的生物数据和信息,每年核酸序列库、蛋白质序列库、蛋白质和核酸结构库、以及各种基因组数据库等都在急剧增加[3]。日本血吸虫抗原很复杂,它包含童虫、成虫和虫卵等的分泌物、排泄物和裂解产物,能够引起宿主免疫应答的物质统称为抗原物质;血吸虫抗原分为膜抗原、虫卵可溶性抗原、微粒体抗原和循环体抗原4类,虫卵可溶性抗原除了具有明显的抗感染免疫作用外,具有抗病免疫作用,还便于提取、电泳和杂交测试[4],所以许多学者对抗原的可溶性进行了研究。……
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