基于16S rRNA部分序列探讨部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系
2012-01-12张源真姜志强
张源真, 王 伟, 姜志强, 张 钊
(大连海洋大学 生命与水产学院 农业部海水增养殖学重点开放实验室, 辽宁 大连 116023)
基于16S rRNA部分序列探讨部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系
张源真, 王 伟, 姜志强, 张 钊
(大连海洋大学 生命与水产学院 农业部海水增养殖学重点开放实验室, 辽宁 大连 116023)
通过PCR扩增获得了3科5属6种中国黄渤海海域的鳚亚目(Blennioidei)鱼类的线粒体16S rRNA基因序列片段约669bp碱基, 结合来自GenBank的5种鳚亚目其他科鱼类的相应基因片段, 并以眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus)为外群, 生成供系统发育分析的序列矩阵, 利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等, 应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树。结果显示:在鳚亚目鱼类的 16S rRNA片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象, 共有207 bp变异位点, 转换/颠换值为0.8, 碱基平均差异为3.36; 支持绵鳚(Enchelyopus elongates)归于鳚亚目绵鳚科(Zoarcidae),鳚(Azuma emmnion)归于鳚亚目线鳚科(Stichaeidae); 方氏云鳚(Enedrias fangi)和云鳚(Enedrias nebulosus)种间遗传距离只有0.01, 亲缘关系最近。
鳚亚目(Blennioidei); 线粒体DNA; 16S rRNA基因序列; 系统发育
鳚亚目(Blennioidei)鱼类是鲈形目(Perciformes)中较大的一个亚目, 已有标本和文献资料显示, 中国海区现有鳚亚目鱼类8科33属78种[1], 多为海洋鱼类, 世界性分布。由于其大多体型较小, 所以以鳚亚目鱼类为研究对象的报道相对较少。目前, 国内外对鳚亚目鱼类的研究较少, 大多局限于形态分类学方面[2-6], 对其分类区系、系统发生, 尤其是分子水平的系统发生研究更是鲜有报道。而鱼类亲缘关系等系统发生进化方面的研究是鱼类生物学的一个重要组成部分, 针对鳚亚目鱼类亚目与科之间及属种之间的系统关系仍不明确的现状[7-9], 研究鳚亚目鱼类分子系统进化关系具有重要意义。……
