奶山羊青春期乳腺发育重要基因RelA的全长克隆
2011-10-19王立娜苑春艳李春李庆章高学军
王立娜,苑春艳,李春,李庆章,高学军
(东北农业大学乳品科学教育部重点实验室,哈尔滨150030)
奶山羊青春期乳腺发育重要基因RelA的全长克隆
王立娜,苑春艳,李春,李庆章,高学军
(东北农业大学乳品科学教育部重点实验室,哈尔滨150030)
从本实验室已建立的关中奶山羊7个时期乳腺Long-SAGE标签库中筛选出在青春期高表达的RelA基因,用RACE方法克隆并获得关中奶山羊RelA基因的全长,将全长序列与NCBI GenBank中人(H.sapiens)和牛(Bos taurus)数据库进行同源性比对,证实用所选EST标签引物克隆出的基因全长是奶山羊RelA基因。
奶山羊;乳腺;RACE;RelA
0 引言
cDNA微阵列杂交技术(cDNA mivroarray hybridization)、长标签基因表达系列分析(Long Serial Analysis of Gene Expression,Long SAGE)等方法使具有潜在功能意义的EST(expressed sequence tag,EST)片段数量大量增加[1],然而EST片段所对应的新基因全长序列的获得,仍然是进行新基因功能研究的障碍[2-5],cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA ends,RACE)技术使未知基因的快速扩增成为可能[6,7]。
目前,人、小鼠、牛等物种的核因子κB(NF-κB)亚单位RelA(V-rel reticuloendotheliosis viral oncogene homolog A(avian),RelA)基因已经克隆出来,但是关于羊的RelA研究还没有报道。为进一步探讨RelA的功能,阐明其在乳腺中发挥的生物学作用,本研究拟通过已构建的奶山羊乳腺EST标签库获得的RelA特异性标签,采用RACE技术克隆关中奶山羊乳腺新基因RelA全长cDNA序列,为进一步研究基因RelA的功能奠定实验基础。
1 材料和方法
1.1 材料和仪器
关中奶山羊青春期乳腺组织(液氮保存),SMARTTM RACE cDNA Amplification Kit(Code No:634914),Trizol(Code No:DRR02AG),pMD18-T载体,DNA Ladder 2000 Marker,PCR仪。
1.2 引物设计
根据本实验室已建立的关中奶山羊乳腺Long-SAGE标签库,选取RelA基因的EST标签,碱基序列为CTGATGGAGTACCCTGA,其NCBI BLAST结果在牛、人的RelA基因同源性为100%。以标签本身作为3'RACE基因特异性引物W6:5'–catgctgatggagtaccctga–3',以3'RACE结果设计5'RACE的基因特异性引物RelA 1:5'–CCCGAGAGGAGGCCATTGGTGAG–3'。……
