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鸭β-防御素-2基因的克隆测序与组织表达分析

2011-08-07张辉华罗艳娜谢青梅马静云杨承忠韩小凤毕英佐

中国兽医杂志 2011年10期
关键词:分析

张辉华,罗艳娜,,谢青梅,马静云,杨承忠,韩小凤,,毕英佐

(1.佛山科学技术学院生命科学院,广东 佛山 528231;2.华南农业大学动物科学院 ,广东 广州 510642)

防御素是一类古老的内源性抗菌多肽,广泛存在于动物体内。自Evans等[1]从鸡与火鸡异嗜性白细胞中发现β-防御素后,已陆续从鸡、鸭、鸵鸟、鹅和企鹅等禽类动物体内分离发现约30个禽β-防御素基因[2-6]。根据Lynn等[7]的建议,国际上对禽防御素命名进行了统一规定,所有禽来源的防御素都命名为AvBDs(Avian beta-defensins)。上传至NCBI GenBank中登记注册的鸭β-防御素基因序列有AvBD2、AvBD6、AvBD9、AvBD10。对鸭 AvBD2的生物学功能研究表明,体外具有抗菌活性与趋化活性[4,8-9],具有潜在的应用价值。因此,本试验对鸭AvBD2基因进行了克隆、序列分析与比较及在机体各组织器官分布的研究,以期为对其功能及调控表达奠定基础。

1 材料与方法

1.1 载体与受体菌 质粒pMD-18T购自宝生物工程(大连)有限公司;受体菌JM109为华南农业大学家禽基因工程实验室保存。

1.2 工具酶与主要试剂 质粒提取试剂盒和凝胶回收试剂盒为Omega公司产品;Trizol Reagent Kit、AMV、Premix Ex Taq聚合酶为宝生物工程(大连)有限公司产品。

1.3 引物 根据GenBank上发表的鸭AvBD2(登录号:AY641439)及β-actin基因序列和PCR引物的设计原则,并借助计算机软件DNAStar进行辅助分析,设计了4条PCR引物,分别用于进行鸭AvBD2与β-actin基因的扩增。引物由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,序列如下。

Duck2-P1:5′-GAGGGAAGGGACCAAGAAGA-3′;Duck2-P2:5′-GGTTGTAACAGGAAGGAGATT-3′;β-actin-P1:5′-ATGTACCCGGGCATCGCTG-3′;β-actin-P2:5′-TCAGAAGCATTTGCGGTGG-3′

1.4 肝脏总RNA提取 取脾脏组织约0.1g,按Trizol试剂盒说明方法提取总RNA。

1.5 鸭AvBD2基因的RT-PCR扩增 通过二步法进行RT-PCR。反转录反应体系:RNA 1μL,10x RT Buffer 1μL,dNTPs(各10mmol/L)1μL,RNA酶抑制剂0.25μL,Oligo dT-Adapter Primer 0.5 μL,AMV 0.5μL,MgCl22μL,DEPC水补至10 μL。混匀后,30℃反应10min,42℃反应30min,99℃反应5min,5℃冷却5min。……

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