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检测猪戊型肝炎病毒的荧光定量PCR方法的建立

2011-08-07张亮权欧阳昀刘志刚曹宗喜闫明菲王文华郭泗虎张桂红

中国兽医杂志 2011年10期
关键词:检测

张亮权,欧阳昀,刘志刚,曹宗喜,闫明菲,王文华,郭泗虎,张桂红

(华南农业大学兽医学院,广东 广州 510642)

戊型肝炎(hepatitis E,HE)是由戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)引起的一种经粪口途径传播的人兽共患病。从1955~1956年在印度新德里[1]第一次HE大暴发至今,HE已广泛分布于亚洲、非洲及中美洲等发展中国家。新疆是我国HE的高发地区,曾在1986~1988年间暴发该病,是世界上一次大规模的流行,共计发病119280例,死亡707例[2]。

1997年Meng等[3]从猪体内分离出1株野生型HEV,发现其与人类的HEV有极高的同源性,并可感染黑猩猩和恒河猴,因此推测猪可能是HEV感染的一个动物宿主。目前研究表明,HEV在猪群中普遍存在,已经被世界卫生组织认定是发展中国家的一个重要公共卫生问题。因此,对猪源戊型肝炎(swHE)诊断方法的研究十分必要。而荧光定量PCR(Real-time PCR)具有快速、灵敏、特异等特点,适用于swHEV的检测,本试验就建立了检测猪群中HEV的荧光定量PCR方法。

1 材料与方法

1.1 病毒与样品来源 猪源戊型肝炎病毒(swHEV),猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、口蹄疫病毒(FMDV)、猪瘟病毒(CSFV)、圆环病毒2型(PCV2)、猪流感病毒(H1、H3亚型SIV)均由本研究室分离保存;16份胆汁样品采集于广东省某兽医院。

1.2 主要试剂和仪器 AMV反转录酶,Ex Taq DNA聚合酶,pMDl8-T载体[宝生物工程(大连)有限公司];SYBR qPCR MIX(TOYOBO公司);荧光定量PCR仪(ABI PRISM 7500型)。

1.3 引物的设计和合成 根据GenBank中swHEV ORF2核苷酸序列的保守区域,应用Primer premier 5.0设计了一对引物并由Invitrogen公司合成,预期扩增片段为126bp。上游引物:5′-CAGAATTGATTTCGTCGG-3′;下游引物:5′-TAGCTATACCCTTGTCCTGCTG-3′。

1.4 样品的处理 胆汁样品用灭菌PBS配成10%的悬浮液,4℃~8000r/min离心10min,取上清,-40℃保存。

1.5 病毒RNA的提取与cDNA的合成 按Invitrogen公司TRIzol®Reagent RNA提取试剂盒的使用说明进行总RNA的抽提,用AMV逆转录酶将总RNA逆转录成cDNA,置-20℃保存。……

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