1株罗汉杉内生放线菌的鉴定、活性分析及抗生素生物合成基因的筛查
2011-01-12郭泽经冯治翔吴华动何艳叶仁元褚以文田永强
郭泽经,冯治翔,吴华动,何艳,叶仁元,褚以文,田永强*
(1.中国医药集团四川抗菌素工业研究所,四川成都610052;2.四川大学化学工程学院,四川成都610065)
植物内生放线菌是指在生活史的一定阶段或全部阶段,生活于健康植物的各种组织或器官内部的放线菌[1-2]。近年来,已知化合物重复发现的概率越来越高[3],而且致病菌对现有药物的抗药性不断增强,促使人们必须寻找更为有效的、新的抗生素。植物内生放线菌是一类相对未开发的微生物资源,受到越来越多研究者的关注。大量的研究表明,植物内生放线菌能产生一系列有生物活性的次级代谢产物,如抗生素、抗肿瘤和抗感染药物、植物生长促进剂和酶[4]。Ezra等[5]从蓬莱蕉植物中分出内生放线菌Streptomyces sp.MSU-2110,能产生一种多肽类抗生素Coronamycins;Igarashi等[6]从蕨类植物分离出1株吸水链霉菌Streptomyces hygroscopicus TP-A0451,能产生较强的抗癌抗生素Pterocidin。Yan LL等[7]从红树林植物中分离出1株链霉菌Streptomyces albidoflavus,能产生抗真菌的大环内酯类抗霉素Antimycin A18。天然活性化合物的筛选,包括分离纯化和结构解析通常要投入大量时间及资金,往往伴随着巨大的风险。现代分子生物学的飞速发展,已出现许多新的检测活性物质的方法[8]。从微生物基因组的角度出发,筛查抗生素生物合成酶基因,可以极大的减少候选菌株的筛选量;而且具有活性的抗生素合成酶基因的候选菌株,其产物结构类型可以作大致推测,便于进一步分离解析。如一些常见的化合物及对应的基因:KS-AT基因对应PKS-I化合物,actⅠORF1-actⅠORF2,KSα-KSβ基因对应PKS-Ⅱ化合物,3,5-AHBA合酶基因对应安莎类抗生素,P450单加氧酶基因oxyB对应糖肽类抗生素[9-11]。……
