高 亮, 乔晓强, 梁 振, 张丽华＊, 霍玉书, 张玉奎

(1.中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院分离分析化学重点实验室,国家色谱研究分析中心,辽宁大连116023;2.中国科学院研究生院,北京100039;3.美国得克萨斯大学,圣安东尼奥78229-3900)

基于在线二维色谱的不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析

高 亮1,2, 乔晓强1,2, 梁 振1, 张丽华1＊, 霍玉书3, 张玉奎1

(1.中国科学院大连化学物理研究所,中国科学院分离分析化学重点实验室,国家色谱研究分析中心,辽宁大连116023;2.中国科学院研究生院,北京100039;3.美国得克萨斯大学,圣安东尼奥78229-3900)

建立了基于在线二维弱阴离子交换色谱-反相液相色谱(2D-WAX-RPLC)的蛋白质分离系统,并用于不同生长时期鹿茸的比较蛋白质组分析。以5种标准蛋白质的混合物为样品,考察了系统的重现性。通过改变标准蛋白质之间的浓度比,研究了该系统进行蛋白质相对定量的能力。在此基础上,针对4个不同生长时期的鹿茸样品,分别采用5种不同的方法进行蛋白质提取,经2D-WAX-RPLC分离后,收集各生长时期对应蛋白质的峰高最大比超过2的组分。酶解后,采用微柱反相液相色谱-串联质谱(μRPLC-MS/MS)进行肽段的分离鉴定;共从9个差异蛋白质峰中鉴定到了22个差异蛋白质。研究结果表明,利用基于蛋白质水平的在线二维液相色谱分离技术找寻差异蛋白质,具有重现性好、自动化程度高等优点,可用于开展比较蛋白质组学的研究。

在线二维液相色谱;鹿茸;蛋白质组;不同生长时期;比较蛋白质……