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常染色体D2S1338基因座被检父稀有等位基因分析

2020-05-19万静邓小娟唐泽英

医学与法学 2020年1期
关键词:基因座亲子鉴定血样

万静 邓小娟 唐泽英

常染色体短串联重复序列STR基因座,是目前广泛运用于亲子鉴定的遗传标记;而在DNA亲子鉴定中,随着鉴定案件的增多,发现稀有等位基因的机率也在增大,这给亲子鉴定结果分析带来困扰。

一、材料与方法

某委托人为明确孩子身份,特委托西南政法大学司法鉴定中心对某被检父、被检子进行单亲亲子鉴定。经现场提取被鉴定人血样2份,应用北京基点认知技术有限公司GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A(免提取)在9700扩增仪上进行复合扩增,扩增产物在ABI3500型遗传分析仪上进行DNA电泳,得结果后再经GeneMapperID-X软件判读,得到各等位基因的基因型。检验结果,被检父在D2S1338基因座为杂合子OL/18;增加宁波海尔思基因科技有限公司STRtyper-21G_PLUS复合扩增系统进行复核检测,其结果仍然相同(详见图1、图2)。

图1 GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A被检父血样

图2 STRtyper-21G_PLUS被检父血样

图3 GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A Ladder

二、检验结果

应用GoldeneyeTMDNA身份鉴定系统20A复合扩增,共检出19个常染色体STR基因座且均符合遗传规律,被检父D2S1338基因座发现OL峰。OL峰又称“off-ladder峰”,一般位于与Ladder上相应等位基因0.5bp范围之外,可分析其前后已自动化正确命名的片段相对与Ladder等位基因的漂移偏离情况,对OL峰进行漂移校正,人工修正命名[1]。

依据相关文献[2]鉴定标准,对OL峰进行分析计算。被检父D2S1338基因座OL峰显示size为203.20(详见图1);为准确判断OL峰的等位基因,依据检材样本等位基因18与同时电泳Ladder等位基因18的bp值分别为223.84(详见图1)和223.82(详见图3),参照文献[3]对OL峰bp值计算,得:223.84-223.82=0.02,表明样本等位基因18相对于Ladder漂移了0.02bp;OL峰bp值扣除漂移,即被Ladder等位基因18的bp值相减,得223.82-(203.20-0.02)=20.64 bp,OL峰实际长度比Ladder等位基因18小20.64bp。由于D2S1338基因座是位于人类二号染色体上的短串联重复序列,其核心序列为(TGCC/TTCC)[4],重复单位为4个碱基对,故该被检父OL峰分型比Ladder等位基因18少5个重复单位,因而该被检父D2S1338基因座OL峰可判断为稀有等位基因13。

三、分析与讨论

笔者查阅了相关文献,在其中袁丽等、李莉等、曹林枝等、刘长晖等、郝宏蕾等、肖莉等、赵芳芳等、霍振义等、于嘉源等、袁亮等、王晓勋等、白雪等、张旋等、刘胜等、朱巍等的16篇报道中,均未发现基因座D2S1338等位基因13。[5]

而徐志成等调研,在11250个日常检案无关个体中发现1例[6];李天光等调研,在黑龙江绥化地区汉族2627例无关个体中该稀有等位基因的基因频率为0.0002[7];张柠等调研,在云南苗族人群747例无关个体中,基因频率为0.0013[8],可计算出该群体中仅有1例检出该等位基因:这三篇文献所涉人群中检出该等位基因的例数和基因频率都极低(详见下表)。

林子清等的调研,在6788个新疆维吾尔族无关个体中,发现13例[9];冯春梅等的调研,在牡丹江市朝鲜族500例无关个体中基因频率为0.0210[10];刘新胜等佛山汉族570例无关个体中,基因频率为0.054386[11]。能看出来基因座D2S1338等位基因13分布相对集中(详见下表)。

分析结果显示,基因座D2S1338等位基因13虽属稀有基因,但在基因频率调查中,显示出其相对集中地分布在新疆维吾尔族、牡丹江朝鲜族、佛山汉族中,具有明显的地区和人群特异性,有利于地域、种族的确认;特别是在刑事案件法医物证鉴定中,其对个体识别与嫌疑人的认定具有重要价值和意义。

目前,基因座D2S1338是亲缘关系鉴定中常用的STR基因座之一,也是常规亲缘关系鉴定规范所推荐的基因座。稀有等位基因的存在,对DNA检验的应用会产生一定的影响;同时,其对提高基因座的个体识别能力、非父排除率有重要的应用价值。但是,若由其产生误判,会影响数据库的应用及各实验室间的数据交流,所以建议在遇到稀有等位基因时,最好采用不同试剂系统进行复核检验。本案被检父的稀有等位基因虽对鉴定结果分析影响不大,但随着案件量的不断增加,鉴定风险会逐步加大,因此在司法鉴定实务中遇此类案件应准确把握,以避免发生错误判断。

表 国内部分地区STR基因座D2S1338等位基因13频率统计

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