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福建省1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的全基因组特征分析

2017-04-19张炎华翁育伟张建明修文琼陈宏彬何文祥谢剑锋郑奎城

中国人兽共患病学报 2017年3期
关键词:流感病毒抗原变异

张炎华,翁育伟,2,张建明,修文琼,陈宏彬,赵 琳,何文祥,朱 颖,谢剑锋,2,郑奎城,2

福建省1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的全基因组特征分析

张炎华1,翁育伟1,2,张建明2,3,修文琼1,陈宏彬1,赵 琳1,何文祥1,朱 颖1,谢剑锋1,2,郑奎城1,2

目的 了解1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1流感病毒的生物学特性和变异情况,为临床治疗与疫情防控提供依据。方法 利用MDCK细胞分离不明原因肺炎病例中的甲型H1N1流感病毒,分离的毒株经全基因组测序后分析其抗原性、致病性和耐药性等特征。结果 从该病例的咽拭子标本中分离得到1株甲型H1N1流感病毒并命名为A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1),其8个节段的核苷酸和氨基酸序列与A/California/07/2009(H1N1)疫苗株的相似性分别为96.9%~98.9%和96.7%~99.5%。氨基酸序列分析显示HA蛋白共有18个位点发生突变,其中K163Q、S185T、S203T和D222N变异涉及到3个不同的抗原位点,提示病毒发生抗原漂移;与受体结合位点相关的D222N突变还提示病毒感染下呼吸道的能力增强。耐药性分析显示该病毒对金刚烷胺耐药,对达菲仍然敏感。结论 本次研究的甲型H1N1流感病毒具有抗原漂移现象,且具备引发重症肺炎的分子特征,应进一步加强监测,为疫情防控奠定基础。

不明原因肺炎;甲型H1N1流感;全基因组特征

Supported by the Natural Science Foundation of Fujian Province, China (No. 2015J01152), the Medical Innovation Subject of Fujian Province (No.2014-CX-9) and the Training Project of Young and Middle-aged Talents in Health System of Fujian Province (No. 2015-ZQN-ZD-10) Corresponding author: Xie Jian-feng, Email: xjf417@163.com

2009年3月,甲型H1N1流感病毒(Pandemic H1N1)在墨西哥首次被发现,随后迅速在全球蔓延开来,成为新的流行亚型之一[1]。甲型H1N1流感病毒经呼吸道传播,其基因组为分节段的单负链RNA,因其基因容易在人类、禽类、畜类等不同宿主中发生突变和重组而经常暴发流行于人群之中。甲型H1N1流感病毒可导致发热、咽痛、流涕、鼻塞、咳嗽、头痛、乏力、全身酸痛等流感样症状,在健康年轻患者中多呈良性经过,较少出现肺炎等并发症。若患者年龄较大或伴有一些基础性疾病,或者病毒发生变异引起致病力的改变,则患者可能出现肺炎等严重的临床症状[2]。不明原因肺炎是由原卫生部于2004年7月下发的《全国不明原因肺炎病例监测实施方案》中提出来的概念,而不明原因肺炎监测是一种筛查SARS(Severe Acute Respiratory Syndrome, 严重急性呼吸道综合征)病例、人禽流感病例及其它传染性呼吸道疾病的重要措施。本文通过分析1例不明原因肺炎病例中甲型H1N1病毒的全基因组特征,了解流感重症病例中甲型H1N1流感病毒的生物学特性和变异情况,为甲型H1N1流感的监测、防控和临床治疗提供依据。

1 材料与方法

1.1 材料

1.1.1 标本来源 2016年2月23日福建省福州市某肺科医院按照不明原因肺炎监测方案向福州市疾病预防控制中心报告1例不明原因肺炎病例。患者为61岁的男性,患病前体健,发病前一周无外出旅行史,家中亦无外人入住,期间未接触过鸡、鸭、鸽子、猪等禽类和畜类,住所周围未发现禽类或畜类异常死亡现象。肺部CT显示该患者肺部感染,呈现肺炎症状。该病例于某部队医院住院治疗4天后未见明显好转,遂转诊至该肺科医院,该院门诊以“不明原因肺炎”收住入院并采集病例咽拭子标本送至福州市疾病预防控制中心检测,标本检测结果为甲型H1N1流感核酸阳性。福州市疾病预防控制中心随后将标本送至福建省疾病预防控制中心流感参比实验室进行进一步研究。

1.1.2 试剂仪器 狗肾传代细胞(MDCK细胞)由中国国家流感中心提供、本实验室保存。病毒RNA提取采用QIAGEN公司的QIAamp○RViral RNA Mini Kit(Cat No:52906),扩增体系采用TaKaRa公司的PrimeScriptTMOne Step RT-PCR Kit Ver.2(Cat No:RR057A),全基因组PCR扩增引物参照世界卫生组织(WHO)网站[3]提供的序列由TaKaRa公司合成。主要仪器为ABI公司的VeritiTMDx 96 Well Thermal Cycler 基因扩增仪。

1.2 方法

1.2.1 病毒分离 患者的咽拭子标本加入青霉素和链霉素后接种至MDCK细胞进行病毒分离,具体方法见参考文献[4]。

1.2.2 核酸提取 按照试剂盒QIAamp○RViral RNA Mini Kit(Cat No:52906)的操作说明进行病毒RNA提取,RNA提取完成后保存于-70 ℃冰箱中。

1.2.3 全基因组RT-PCR扩增与测序 按照TaKaRa公司的PrimeScriptTMOne Step RT-PCR Kit Ver.2试剂盒配制的50 μL反应体系如下:2× one step buffer(Dye plus) 25 μL,PrimeScript one step Enzyme Mix 2 μL,上下游引物各2 μL(10 μmol/L),病毒RNA 5 μL,RNase Free dH2O 14 μL。反应条件为:50 ℃ 30 min,94 ℃ 2 min;94 ℃ 30 s,60 ℃ 30 s,72 ℃ 1 min/kb,循环30次;72 ℃ 5 min,4 ℃保温。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳进行检测鉴定后送铂尚生物技术(上海)有限公司进行双向测序。

1.2.4 全基因组序列拼接与分析 利用DNA Star 7.1.0和MEGA 6.1软件对序列进行拼接、比对、同源性分析以及进化树的构建。采用Neighbor-Joining(NJ)法构建进化树,并用Bootstrap法(replication=1 000)进行检验。以疫苗株A/California/07/2009(H1N1)为参照对病毒全基因组核苷酸序列和氨基酸序列进行抗原性、致病性和耐药性等特征进行分析。通过NetNGlyc 1.0 server 在线分析软件对HA蛋白进行糖基化位点分析。本文所用核苷酸序列来源于GenBank和GISAID网站。

2 结 果

2.1 病毒分离结果 咽拭子标本在MDCK细胞中传代3次后,获得一份血凝试验阳性的培养物,其血凝滴度(1%火鸡血红细胞)为16,经血凝抑制试验鉴定为甲型H1N1流感病毒,并命名为A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)。

2.2 基因扩增与测序结果 经22对引物扩增,成功获得A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)的全基因组片段。各片段经双向测序和拼接后,获得病毒基因组8个节段的完整编码序列(PB2:2 280 bp;PB1:2 274 bp;PA:2 151 bp;HA:1 701 bp;NP:1 497 bp;NA:1 410 bp;M:982 bp;NS:863 bp),序列在NCBI网站基因数据库BLAST比对结果均显示为甲型H1N1流感病毒基因。

2.3 全基因组相似性分析结果 以疫苗株A/California/07/2009(H1N1)为参照标准,对A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)核苷酸和氨基酸序列进行相似性分析。结果发现,A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)不同基因节段的核苷酸和氨基酸序列与疫苗株的相似性分别为96.9%~98.9%和96.7%~99.5%。其中,HA节段的核苷酸和氨基酸的相似性最小,分别只有96.9%和96.7%,表明HA的变异程度最大。详见表1。

表1 A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)流感毒株与疫苗株的基因相似性比较

Tab.1 Comparison of genetic similarity between the A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1) and the vaccine strain

ViralstrainA/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)SegmentAminoacidlengthSimilarityofnucleotide(%)Similarityofaminoacid(%)A/California/07/PB275998.298.92009(H1N1)PB175798.299.5PA71698.599.2HA56696.996.7NP49898.299.0NA46997.996.8M252(M1)98.998.897(M2)98.699.0NS219(NS1)97.697.7121(NS2)98.498.4

2.4 全基因组系统进化分析结果 从GenBank和GISAID上下载甲型H1N1流感疫苗株A/California/07/2009(H1N1)、福建省首例甲型H1N1流感毒株A/Fujian/01/2009/(H1N1)、福建省达菲耐药株A/Fuzhou/SWL11609/2013(H1N1)以及国内外部分地区不同年份的甲型H1N1流感全基因组序列(详见表2),对本次研究的病毒进行全基因组系统进化分析。系统进化分析显示,A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)病毒株的8个节段基因都分别与疫苗株分布在不同的大分支上,其主要与2013年以后的毒株形成大的分支,而疫苗株A/California/07/2009(H1N1)则主要与2013年以前的毒株形成分支。值得注意的是,A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)病毒株的8个节段基因核苷酸均与2015年上海的A/Shanghai-Putuo/1860/2015(H1N1)亲缘关系最近。全基因组进化分析情况详见图1。

2.5 氨基酸位点分析

2.5.1 血凝素蛋白(HA)氨基酸位点分析结果 相对于疫苗株A/California/07/2009/(H1N1)而言,本次研究的甲型H1N1流感病毒HA蛋白发生了较大的变异,突变率达到了3.28%。HA蛋白(不含信号肽)共发生了18处突变,分别是D14A、P83S、D97N、V152T、K163Q、 V173I、S185T、S203T、D222N、A256T、A261S、K283E、I321V、E374K、S451N、E491G、E499K、D501E。其中,K163Q变异位于Sa抗原决定簇,S185T 变异位于Sb抗原决定簇,S203T和 D222N变异位于Ca抗原决定簇,共有4个氨基酸位点变异涉及到3个抗原位点。D222N变异不仅位于抗原决定簇,而且还与受体结合位点(Receptor binding site,RBS)有关,可能导致肺炎等严重的临床症状。与致病性相关的HA蛋白裂解位点氨基酸序列为V338PSIQSR↓GLFGAI,裂解位点只有一个碱性氨基酸,仍保持低致病性特征。经NetNGlyc 1.0 server软件在线分析发现,与病毒抗原性、致病性和稳定性相关的HA蛋白糖基化位点未发生明显变化(表3)。此外,HA蛋白信号肽发生了A13T突变,由丙氨酸(A)变异为疏水性较弱的苏氨酸(T),可能使信号肽的疏水性减弱进而影响HA蛋白运输和定位。

表2 系统进化分析中的毒株名称及来源

Tab.2 Strains and origination in phylogenetic analysis

StrainsDatabaseAccessionNO./IsolateIDPB2PB1PAHANPNAMNSA/California/07/2009(H1N1)GenBankKU93348KU93348KU93348KU93348KU93348KU93348KU93348KU93348A/Egypt/42/2014(H1N1)GenBankKP70217KP70217KP70218KP70218KP70218KP70218KP70218KP70218A/ferret/Taiwan/E01/2013(H1N1)GenBankKJ70201KJ70201KJ70201KJ70201KJ70201KJ70201KJ70201KJ70201A/Finland/76/2014(H1N1)GenBankKM4378KM4378KM4378KM4378KM4378KM4378KM4378KM4378A/FuZhou/SWL11609/2013(H1N1)GenBankKT18031KT18031KT18031KP01991KT18031KP01980KT18031KT18031A/Hawaii/22/2016(H1N1)GenBankKX40947KX40947KX40947KX40947KX40947KX40947KX40947KX40947A/HongKong/H090-779-V10/2009(H1N1)GenBankCY12043CY12043CY12043CY12043CY12043CY12043CY12043CY12043A/Indiana/33/2016(H1N1)GenBankKX40992KX40992KX40993KX40993KX40993KX40993KX40993KX40993A/Kyoto/13K017/2014(H1N1)GenBankLC03285LC03285LC03285LC03285LC03285LC03285LC03286LC03286A/NorthCarolina/38/2016(H1N1)GenBankKX41124KX41124KX41124KX41124KX41124KX41124KX41124KX41124A/Qingdao/FF86/2009(H1N1)GenBankKF41114KF41132KF41129KF41118KF41123KF41118KF41120KF41126A/Shanghai/Mix1/2014(H1N1)GenBankKP05849KP05849KP05849KJ94641KP05849KJ94641KP05849KP05849A/Singapore/DMS1213/2011(H1N1)GenBankKT18061KT18039KT18082KT18103KT18125KT18146KT18168KT18189A/Thailand/CU-H2548/2010(H1N1)GenBankCY08944CY08944CY08944CY08944CY08944CY08944CY08945CY08945A/Tianjinnankai/SWL413/2010(H1N1)GenBankJQ71414JQ71415JQ71416JQ71416JQ71418JQ71419JQ71419JQ71420A/turkey/Ontario/FAV-005-2/2016(H1N1)GenBankKX23247KX23247KX23247KX23247KX23247KX23247KX23248KX23248A/Fujian/1/2009(H1N1)GenBankGQ22536GQ22536GQ22536GQ22536GQ22536GQ22536GQ22536GQ22536A/Ulaanbaatar/2973/2015(H1N1)GISAIDEPI_ISL_223300(completegenome)A/Yokohama/50/2015(H1N1)GISAIDEPI_ISL_223345(completegenome)A/Vietnam/GS150925/2015(H1N1)GISAIDEPI_ISL_223347(completegenome)A/India/4051/2015(H1N1)GISAIDEPI_ISL_224289(completegenome)A/Shanghai-Putuo/1860/2015(H1N1)GISAIDEPI_ISL_211949(completegenome)

●A/California/07/2009(H1N1), ▲A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)图1 A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)的遗传进化分析Fig.1 Phylogenetic analysis of the A/FujianGulou/SWL64/2016 (H1N1)

表3 A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)与疫苗株的HA蛋白糖基化位点预测比较

Tab.3 Prediction of N-glycosylation sites in the hemagglutinin (HA) proteins of A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1) and vaccine strain

SequencePositionPotentialJuryagreementN-Glycresult(Threshold=0.5)A/California/07/2009(H1N1)27NNST0.3900(8/9)-28NSTD0.7996(9/9)+++40NVTV0.7476(9/9)++104NGTC0.6786(8/9)+293NTTC0.4821(5/9)-304NTSL0.6616(9/9)++498NGTY0.5209(4/9)+557NGSL0.6833(9/9)++A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)27NNST0.3636(9/9)--28NSTA0.7791(9/9)+++40NVTV0.7512(9/9)+++104NGTC0.6428(8/9)+293NTTC0.4867(5/9)-304NTSL0.6709(9/9)++498NGTY0.5233(4/9)+557NGSL0.6833(9/9)++

2.5.2 神经氨酸酶蛋白(NA)和膜蛋白(M)氨基酸位点分析结果 与流感病毒耐药相关的蛋白主要是离子通道蛋白(M2)和神经氨酸酶蛋白(NA)。M2蛋白仅发生了D21G突变,突变率为1.03%,与耐药相关的第26、27、30、31和34位氨基酸[5]均未发生突变,其中跨膜区的第31位氨基酸仍为天冬酰胺(N),提示其对金刚烷胺类药物依然耐药[6]。而NA蛋白的突变率较高,达3.20%。NA蛋白共发生了15处变异,分别是L40I、N44S、V67I、S82F、N200S、V241I、N248D、V264I、N270K、I321V、Y351F、N369K、T381I、N386K、K432E。与神经氨酸酶抑制剂作用位点相关的第275位氨基酸仍为组氨酸(H),提示该流感病毒对达菲仍然敏感。此外作为未来抗病毒药物研究方向的NP蛋白,其中的一些重要氨基酸位点,如148Y、355R、361R等[7]也未发生变化。

2.5.3 其他蛋白氨基酸位点分析结果 甲型流感病毒的其他蛋白包括PB2、PB1、PA、NP和NS蛋白。聚合酶PB2、PB1和PA共同构成RNA聚合酶复合体,而RNA聚合酶复合体与NP蛋白共同工程病毒核糖核蛋白体复合物(viral ribonucleoprotein complexes,vRNP),参与流感病毒基因组的复制和转录[8]。本次研究的流感病毒PB2、PB1、PA和NP蛋白中影响病毒致病性的几个关键位点均未发生改变,如PB2蛋白中仍为457L[9]、627E[10]、701D[8]和714S[11-12];PB1蛋白中的622S、709V以及PB1-F蛋白的66N也未发生突变[13];PA蛋白中仍表现为154E[14]、157T[15]、638R[16]。非结构蛋白NS1中与病毒复制能力相关的69L、77L[17]和与病毒毒力有关的103F、106M[18]也未发生变化。各蛋白的氨基酸位点变异情况详见表4。

表4 A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)病毒株全基因组氨基酸位点变异情况

Tab.4 Mutations sites of amino acid on the complete genome of A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)

SegmentMutationssitesofaminoacidNo.ofmutationMutationrate(%)PB2R54KM66ID195NR293KV344MI354LS453PV731I81.05PB1G154DI397MI435TD618E40.53PAV100TP224SN321KI330VK361RR362K60.84HAD14AP83SD97NV152TK163QV173IS185TS203TD222NA256TA261SK283EI321VE374KS451NE491GE499KD501E183.28NPA22TV100IM105TL122QS498N51.00NAL40IN44SV67IS82FN200SV241IN248DV264II321V153.20N270KI321VY351FN369KT381IN386KK432EM1V80IM192VK230R31.19M2D21G11.03NS1E55KL90II123VK131EN205S52.28NS2N29ST48A21.65

3 讨 论

流感病毒的抗原性、致病性和耐药性等生物学特性对流感疫情的防控和临床治疗具有重要参考意义。分节段的单股负链RNA基因结构是流感病毒容易发生突变和(或)重组的分子基础。而发生突变和(或)重组的病毒由于人群缺乏特异性免疫力而有可能在人群中暴发和流行。本文报告了1例在不明原因肺炎监测中发现的重症流感病例,并对该病例中的甲型H1N1流感病毒进行生物学特性的研究,及时发现病毒的变异情况,对流感的防控和治疗具有一定的意义。

一般认为,HA蛋白内部有4个抗原决定簇,分别是Sa(141~142、170~174、176~181)、Sb(201~212)、Ca1(183~187、220~222、252~254)和Ca2(154~159、238~239)以及Cb(87~92)[19](该参考文献中的HA氨基酸序列包含信号肽的17个氨基酸,而本文中的序列未将信号肽计入)。若HA1区蛋白上发生4个以上氨基酸替换,且替换涉及到2个及以上抗原决定簇位点,就可以认为出现了具有流行病学意义的抗原变异株[20]。本次研究中,病毒HA蛋白的K163Q变异位于Sa抗原决定簇,S185T 变异位于Sb抗原决定簇,S203T和 D222N变异位于Ca抗原决定簇,共有4个氨基酸位点变异涉及到3个抗原位点,出现了抗原漂移现象。而HA基因的相似性只有疫苗株的96.9%,为8个基因节段之最低,HA蛋白的突变率更是达到了3.28%,这也表明该病毒的抗原性发生了一定程度的变异。

除了抗原性的变化,该病毒还可能发生了致病能力的改变。甲型H1N1流感病毒的致病力与多种因素有关,如HA裂解位点、受体结合位点、PB2蛋白的E627K和D701N突变、PA-X的长短、PB1-F2、NS1蛋白等。本次研究中PB2蛋白第627和701位氨基酸未发生突变, PA-X的长短、PB1-F2和NS1蛋白也未发现具致病力相关的突变。该病毒HA裂解位点为V338PSIQSR↓G,裂解位点仍然只有单个碱性氨基酸(R),尽管第338位的氨基酸与疫苗株的I338PSIQSR↓G不同,但其致病性并不受影响,仍然表现为低致病性[21]。有研究显示[22],人类的上呼吸道主要表达α-2,6-半乳糖唾液酸(SA-α-2,6-Gal)受体,下呼吸道主要表达α-2,3-半乳糖唾液酸(SA-α-2,3-Gal)受体。人流感能特异性地结合SA-α-2,6-Gal受体,一般引起上呼吸道症状,症状较轻;而禽流感能特异性地结合SA-α-2,3-Gal受体,引起下呼吸道症状,体温多在39 ℃以上,常可进展为肺炎表现,重者可发展为呼吸窘迫综合征(ARDS)。有研究发现,位于受体结合位点的D222N突变能明显提高病毒与SA-α-2,3-Gal受体结合的能力[23],使流感病毒感染下呼吸道的可能性增加,进而可能加重患者的临床症状[24]。本例不明原因肺炎患者为一位61岁的男性,发病时体温最高达39.5度,伴胸闷、咳嗽、咳痰,无咯血,肺部CT显示肺部感染、肺炎,具有明显的下呼吸道感染特征。该患者体内分离出的病毒存在HA基因的D222N突变,这或许是患者出现肺炎症状的重要原因之一。

在病毒耐药性方面,M2蛋白位于跨膜区的第31位氨基酸(N)也提示其对金刚烷胺类药物产生耐药,但与神经氨酸酶抑制剂作用位点相关的第275位氨基酸仍为组氨酸(H),提示该病毒对达菲仍然敏感。这对于临床治疗具有重要的指导意义。

此外,系统进化树分析发现A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)病毒株的8个节段基因均与2015年上海的A/ShanghaiPutuo/1860/2015(H1N1)亲缘关系最近,而且该病毒出现在A/ShanghaiPutuo/1860/2015(H1N1)之后,提示该病毒可能由上海普陀的这株病毒进化而来。进一步对A/ShanghaiPutuo/1860/2015(H1N1)病毒株的HA和NA基因进行分析发现,A/ShanghaiPutuo/1860/2015(H1N1)与A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1)的变异情况非常相似,不同之处是后者的HA基因在前者的基础上多了D14A和D222N变异,而NA基因则多了S82F变异,这也提示后者可能由前者进化而来。

在今后的流感防控工作中,我们要警惕这种抗原性和致病性都发生变化的流感病毒,加强重症呼吸道疾病和不明原因肺炎的病例搜索,密切监测流感病毒的病原学和流行病学特征变化,及时为疫情防控和临床治疗提供科学依据。

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Complete genome analysis of influenza A(H1N1) pdm09 virus isolated from one case of pneumonia of unknown etiology (PUE) in Fujian Province, China

ZHANG Yan-hua1, WENG Yu-wei1,2, ZHANG Jian-ming2,3,XIU Wen-qiong1, CHEN Hong-bin1, ZHAO Lin1, HE Wen-xiang1, ZHU Ying1, XIE Jian-feng1,2, ZHENG Kui-cheng1,2

(1.FujianCenterforDiseaseControlandPrevention,PriorityLaboratoryforZoonosesResearchofFujian,Fuzhou350001,China;2.SchoolofPublicHealth,FujianMedicalUniversity,Fuzhou350108,China;3.FujianInternationalTravelHealthCareCenter,Fuzhou350001,China)

To study the biological characteristics and mutations of influenza A(H1N1)pdm09 virus isolated from one case of pneumonia of unknown etiology (PUE), which would provide references for clinical treatment and disease control, the throat swab specimen from the PUE case was isolated in the Madin-Darby Canine Kidney (MDCK) cells, and then the antigenicity, pathogenicity and drug resistance of influenza A (H1N1) pdm09 virus were analyzed after sequencing. As a result, one influenza virus strain was isolated from the specimen and named as A/FujianGulou/SWL64/2016(H1N1). The similarities of nucleotide sequences and amino acids sequences compared with the vaccine strain A/California/07/2009(H1N1) were 96.9%-98.9% and 96.7%-99.5%, respectively. Eighteen amino acids had mutated in the HA and 4 mutations, K163Q, S185T, S203T and D222N, were involved in 3 different epitopes, which indicated that the antigenic drift had occurred in the influenza virus. The D222N mutation associated with receptor binding site made the virus infect lower respiratory tract more easily. The virus was still amantadine-resistance and oseltamivir-sensitive.In conclusion, the influenza A (H1N1) pdm09 virus in this study have occurred antigenic drift and has the molecular characterization of causing severe pneumonia, so further surveillance should be performed to prevent and control the influenza epidemic.

pneumonia of unknown etiology (PUE); influenza A(H1N1)pdm09 virus; characteristics of complete genome

10.3969/j.issn.1002-2694.2017.03.007

谢剑锋,Email: xjf417@163.com

1.福建省疾病预防控制中心 福建省人兽共患病研究重点实验室,福州 350001; 2.福建医科大学公共卫生学院,福州 350108 3.福建省国际旅行卫生保健中心,福州 350001

R373.1

A

1002-2694(2017)03-0228-08

2016-08-08 编辑:张智芳 林 丹

福建省自然科学基金(No. 2015J01152);福建省医学创新课题(No. 2014-CX-9)资助;福建省卫生系统中青年骨干人才培养项目(No. 2015-ZQN-ZD-10)

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