电子结肠镜检查有助于预防结直肠癌发生，其保护作用的强度和持续时间，特别是对近端结肠的保护作用还需进一步研究。美国麻省总医院胃肠科的Chan博士等人对此进行了研究，他们发现结肠镜检查是有效的结直肠癌筛查方法。研究人员检验了Nurses'健康研究及医疗专业随访研究的受试人群中低位结肠内镜检查(1988至2008，两年一次更新)与结直肠癌发生率(至2010年6月)及结直肠癌死亡率(至2012年6月)之间的相关性。研究由此得出结论:电子结肠镜检查与远端结直肠癌发生率下降相关;电子结肠镜检查与近端结肠癌发生率的适度下降相关。经电子结肠镜检查筛查与结直肠癌死亡率下降相关;而仅电子结肠镜检查与近端结肠癌死亡率的下降相关。与从未接受电子结肠镜检查或电子结肠镜检查超过5年后诊断为结直肠癌的患者相比，电子结肠镜检查后5年内诊断为结直肠癌的患者更易出现CpG岛甲基化现象和微卫星不稳定性。