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密斑刺鲀(Diodon hystrix)fshβ和lhβ基因的克隆及表达分析*

2023-12-06郭煜文李奕凯戴明姝梁隽浩黄彦霖李广丽陈华谱

海洋与湖沼 2023年6期
关键词:性腺垂体克隆

郭煜文 李奕凯 戴明姝 梁隽浩 黄彦霖 李广丽 陈华谱

密斑刺鲀(Diodon hystrix)fshβ和lhβ基因的克隆及表达分析*

郭煜文 李奕凯 戴明姝 梁隽浩 黄彦霖 李广丽 陈华谱①

(广东省名特优鱼类生殖调控与繁育工程技术研究中心 广东省海水养殖生物育种工程实验室 广东海洋大学水产学院 广东湛江 524088)

密斑刺鲀()是南海名特优鱼类, 同时具备食用和中药保健价值, 但目前关于密斑刺鲀生殖生理的研究较少, 影响了该鱼繁育理论研究的发展。众所周知, 促性腺激素(Gonadotropic hormone, GtH)是生殖调控的关键激素之一, 在生殖调控轴中发挥着承上启下的作用。利用转录组分析及分子克隆技术从密斑刺鲀中克隆并鉴定出和基因的cDNA序列, 通过生物信息学分析, 发现密斑刺鲀cDNA开放阅读框共363 bp, 编码120个氨基酸;cDNA开放阅读框共420 bp, 编码139个氨基酸。通过序列比对和系统进化树分析, 表明密斑刺鲀Fshβ和Lhβ均与鲀科类的鱼的亲缘关系较近。利用三级结构分析, 发现Fshβ的三级结构相对保守, 而Lhβ的三级结构差异较大。利用实时荧光定量的方法检测了密斑刺鲀和基因的组织分布情况, 结果表明密斑刺鲀和在垂体的表达量最高, 其次是性腺。此外, 进一步检测了和基因在雌雄性腺发育过程中的表达模式, 发现垂体中基因伴随性腺的发育, 表达量逐渐下降, 而基因的表达量呈逐渐增加模式。研究结果将为构建密斑刺鲀生殖调控网络提供研究基础。

密斑刺鲀;;; 分子克隆; 表达模式

在下丘脑-垂体-性腺(HPG)生殖调控轴中, 垂体是中间节点, 其分泌的促性腺激素(Gonadotropic hormone, GtH)是介导生殖调控的重要分子, 并在生殖轴中起到承上启下的关键作用。促性腺激素, 包括卵泡刺激素(follicle-stimulating hormone, Fsh)和黄体生成素(luteinizing hormone, Lh)。Fsh和Lh均为异二聚体、非共价结合的糖蛋白, 由一个相同的α亚基和一个激素特异性β亚基组成。每个亚基都由独立的基因编码(Pierce, 1981; Fiddes, 1984)。在哺乳动物中, Fsh和Lh由同一种促性腺激素细胞产生(Nakane, 1970), 但在硬骨鱼类中, Fsh和Lh主要由存在于硬骨鱼脑垂体远侧部和中间部的不同的细胞群合成和分泌(Weltzien, 2003; Zhou, 2010), 这表明硬骨鱼类的Fsh和Lh具有不同的分泌调节机制和生理调控功能(Kim, 2005)。

目前, Fsh和Lh已在欧洲鳗鲡()、日本鳗鲡()、大西洋鲑()和草鱼()等多种硬骨鱼类中克隆和鉴定, 并开展了分子结构和表达分析(Chang, 1988, 1990; Degani, 2003; Kim, 2005; Jeng, 2007; Banerjee, 2008; Zhou, 2010)。Fsh和Lh主要是受到来源于下丘脑神经元的促性腺激素释放激素(gonadotropin-releasing hormone, GnRH)的刺激而合成与释放, 释放后的Fsh和Lh分别与性腺中对应的受体Fshr和Lhr结合, 然后促进性腺合成性类固醇激素, 进而调节性腺的发育和成熟(Weltzien, 2004; 翟毅等, 2018)。研究表明, Fsh和Lh在性腺发育调控过程中具有互补作用, 在生殖周期的不同阶段,和在脑垂体中的表达存在明显差异。在裸盖鱼()的性腺发育过程中,和mRNA在垂体中的表达逐渐增加, 并在成熟期中表达量最高(Guzmán, 2018); 在美洲条纹狼鲈()雌鱼卵巢发育早期,和表达量同样逐步增加, 在卵黄生成后期,的mRNA含量降低到基础水平, 但GtHα亚基和mRNA始终保持较高的表达水平(Hassin, 1995); GtH基因的表达特征是在配子发生的早期阶段表达量高, 并被认为作用于性腺早期的卵子发育和精子发生。另一方面,在配子发生的早期阶段表达量低, 甚至检测不到, 但在性腺成熟阶段表达量达到最高, 并被认为主要作用于配子成熟(Kagawa, 1998b)。

密斑刺鲀(Linnaeus, 1758), 俗称斑点河鲀, 隶属于鲀形目(Tetraodontiformes), 刺鲀科(Diodontidae), 刺鲀属(), 主要分布在亚热带海域的潟湖和珊瑚礁中。当前关于密斑刺鲀生殖调控的相关研究较少, 只是涉及促性腺激素释放激素和性腺转录组分析等研究(陈华谱等, 2021; Chen, 2021)。由此, 本研究旨在克隆密斑刺鲀和的cDNA序列并分析其结构特征, 研究密斑刺鲀和的表达模式, 为后续探究密斑刺鲀Fsh和Lh在生殖内分泌调控中的生理功能及构建完整的密斑刺鲀生殖调控轴提供理论基础。

1 材料与方法

1.1 实验材料

实验所用密斑刺鲀()为海南省三亚市近海捕捞, 经MS-222麻醉剂(Sigma, 美国)麻醉后解剖, 取心脏、肝脏、脾脏、肾脏、垂体、脑、卵巢和精巢等组织, 经液氮速冻后保存于–80 °C冰箱待用。

1.2 实验试剂

总RNA提取试剂盒Trizol Reagent和PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time)试剂盒(TaKaRa, 日本); 载体和感受态细胞-T3Cloning Kit、2×EasyTaq®PCR SuperMix (+dye)和PerfectStart®Green qPCR SuperMix (全式金生物, 北京); 胶回收试剂盒和质粒提取(东盛生物, 广州); 其余化学试剂均为国产分析纯试剂。

1.3 总RNA提取和cDNA的合成

将保存于–80 °C的组织取出破碎匀浆, 使用Trizol Reagent试剂盒提取密斑刺鲀各组织总RNA。RNA完整性使用1.5%琼脂糖凝胶电泳验证。取1 μg RNA样品, 使用PrimeScriptTMRT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time)试剂盒反转录合成cDNA。

1.4 fshβ和lhβ基因的cDNA克隆

1.4.1 引物设计 利用同源比对的方法, 从密斑刺鲀转录组数据(NCBI: PRJNA674446)中进行在线BLAST, 获取到密斑刺鲀和的基因序列, 并根据目的基因片段, 设计全长克隆和特异性引物(表l)。

表1 密斑刺鲀和基因克隆及组织分布的引物

Tab.1 Primers for cloning and tissue distribution of fshβ and lhβ in D. hystrix

1.4.2 分子克隆 以密斑刺鲀垂体组织的cDNA为模板, 结合和全长克隆引物, 按照前期研究的基因克隆方法进行密斑刺鲀和基因的克隆(陈华谱等, 2017)。PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳检测。将目的片段连接到-T3载体上, 转化至1-T1感受态细胞, 筛选阳性结果送公司测序。

1.5 生物信息学分析

用DNAstar 7.1软件预测密斑刺鲀和的开放阅读框并翻译为氨基酸序列, 进行同源性比对。运用在线网站SignalP 6.0 (https://services.healthtech. dtu.dk/service.php?SignalP)预测信号肽。运用在线网站SoftBerry (http://www.softberry.com/)预测蛋白质功能位点。运用Mega 11.0软件构建系统进化树。运用在线网站Swiss-model (https://swissmodel.expasy.org/)进行蛋白质三级结构预测及分析。

1.6 fshβ和lhβ基因的组织表达模式

将密斑刺鲀心脏、肝脏、脾脏、肾脏、垂体、脑、卵巢和精巢等组织的cDNA作为模板, 参照PerfectStart®Green qPCR SuperMix试剂盒说明书准备反应体系, 利用Roche LightCycler 480 (Roche, 瑞士)检测和在各组织中的表达, 内参为基因。qPCR反应体系为10 μL︰5 μL qPCR SuperMix, 0.4 μL上游引物, 0.4 μL下游引物, 1 μL cDNA模板, 3.2 μL无酶水。反应程序为: 首先95 °C预变性1 min; 95 °C变性5 s, 57 °C退火10 s, 72 °C延伸20 s, 84 °C收集荧光10 s, 共40个循环; 溶解曲线: 95 °C 1 min, 52 °C 1 min, 95 °C延伸。每个样品3次重复, 用=2–∆∆Ct方法计算其相对表达量, 并使用SPSS 25.0软件进行统计分析。

1.7 性腺发育过程中fshβ和lhβ基因在垂体中的表达模式

将密斑刺鲀麻醉后取其性腺及垂体组织, 依照Chen等(2020)石蜡切片方法对性腺进行切片观察和组织学分析, 鉴定其发育时期后将对应的垂体组织进行归类。将垂体组织的cDNA作为模板, 实时荧光定量的方法与上述1.6相同, 每个样品5次重复, 检测不同性腺发育时期的垂体组织中和基因的相对表达量。

2 结果与分析

2.1 密斑刺鲀fshβ和lhβ基因cDNA克隆及序列分析

通过对克隆获得的序列进行分析, 发现密斑刺鲀cDNA开放阅读框共363 bp, 编码120个氨基酸, 分子量(MW)为13.17 kDa, 理论等电点(pI)为6.01。其中1~18位氨基酸为信号肽, 19~120位氨基酸为成熟肽, 成熟肽部分包含了12个保守的半胱氨酸残基, 19~117位氨基酸为功能结构保守区糖蛋白激素β链同系物(glycoprotein hormone beta chain homologues,GHB)。此外, 在Fshβ氨基酸序列中含有一个N-糖基化位点(图1)。

图1 密斑刺鲀fshβ基因开放阅读框序列及其推测的氨基酸序列

密斑刺鲀cDNA开放阅读框共420 bp, 编码139个氨基酸, 分子量为15.67 kDa, 理论等电点为5.61。其中1~19位氨基酸为信号肽, 20~139位氨基酸为成熟肽, 成熟肽部分包含了12个保守的半胱氨酸残基, 21~126位氨基酸为功能结构保守区GHB。此外, 在Lhβ氨基酸序列中含有一个N-糖基化位点(图2)。

2.2 密斑刺鲀Fshβ和Lhβ其他功能位点预测

通过SoftBerry网站预测Fshβ和Lhβ其他功能位点。Fshβ功能位点包括: N-豆蔻酰化位点、异戊烯基团结合位点及微体C-末端靶向信号(表2); Lhβ功能位点包括: 蛋白激酶C磷酸化位点、N-豆蔻酰化位点、原核膜脂质附着位点、异戊烯基团结合位点及糖蛋白激素β链特征1、糖蛋白激素β链特征2 (表3)。

2.3 密斑刺鲀Fshβ和Lhβ的氨基酸序列比对及同源性分析

2.3.1 Fshβ的氨基酸序列比对及同源性分析 将密斑刺鲀与红鳍东方鲀()、菊黄东方鲀()和尼罗河鲈鱼()等9种脊椎动物Fshβ的氨基酸序列进行多重序列比对及同源性分析。结果显示, 密斑刺鲀Fshβ的氨基酸序列与同为鲀形目的菊黄东方鲀的同源性最高, 为67.5%; 与哺乳类动物小鼠()和智人()的同源性较低, 分别是28.3%和28.7% (图3) (表4)。

图2 密斑刺鲀lhβ基因开放阅读框序列及其推测的氨基酸序列

表2 密斑刺鲀Fshβ氨基酸序列中的功能位点

Tab.2 Functional sites in Fshβ amino acid sequence of D. hystrix

表3 密斑刺鲀Lhβ氨基酸序列中的功能位点

Tab.3 Functional sites in Lhβ amino acid sequence of D. hystrix

2.3.2 Lhβ的氨基酸序列比对及同源性分析 对密斑刺鲀与斑马鱼、高体鰤()和红鳍东方鲀等9种脊椎动物Lhβ的氨基酸序列进行多重序列比对及同源性分析。结果显示, 鱼类Lhβ的氨基酸序列的C-末端区域十分保守, 但N-末端区域与其他硬骨鱼类和哺乳动物差异较大(图4)。密斑刺鲀与同为鲀形目的菊黄东方鲀的同源性最高, 为70.2%; 与哺乳类动物小鼠和智人的同源性较低, 分别是44.5%和40.6% (表5)。

2.4 密斑刺鲀Fshβ和Lhβ系统进化树分析

运用邻位相连算法(Neighbor-Joining)构建密斑刺鲀与其他脊椎动物Fshβ和Lhβ的系统进化树, 以确定密斑刺鲀Fshβ和Lhβ的进化关系。结果表明, 脊椎动物Fshβ聚类为一个独立的进化分支, 而Lhβ则聚类为另一个独立进化分支。其中密斑刺鲀Fshβ和Lhβ与红鳍东方鲀和菊黄东方鲀等鲀型目鱼类的亲缘关系较近(图5)。

2.5 密斑刺鲀Fshβ和Lhβ蛋白质三级结构预测

利用Swiss-model网站预测密斑刺鲀和其他脊椎动物Fshβ和Lhβ成熟肽的三级结构。结果显示, 密斑刺鲀Fshβ成熟肽的三级结构与人和红鳍东方鲀的Fshβ高度相似。而密斑刺鲀Lhβ成熟肽的三级结构与红鳍东方鲀的Lhβ结构相似, 但与人的Lhβ结构差异较大(图6)。

2.6 密斑刺鲀fshβ和lhβ基因的组织表达

通过实时荧光定量的方法检测密斑刺鲀不同组织中和mRNA的表达水平。结果表明, 密斑刺鲀和在各组织中都有分布, 在雄鱼和雌鱼垂体中的表达量最高, 在性腺中的表达量次之, 而在心脏、脾脏和肾脏中表达量较低(图7)。

图3 密斑刺鲀与其他物种Fshβ氨基酸序列的多重比对

注: 以上各物种的NCBI登录号:(红鳍东方鲀) XP_011608222.1,(菊黄东方鲀) TWW67736.1,(尼罗河鲈鱼) AKE14361.1,(铅点东方鲀) BAJ12081.1,(条石鲷) AIZ66846.1,(乌鳢) KAF3686704.1,(小鼠) AAA92804.1,(智人) ABM88373.1,(斑马鱼) AAR84282.1

表4 密斑刺鲀Fshβ与其他物种的同源性

Tab.4 Homology of Fshβ between D. hystrix and other species

2.7 性腺发育过程中fshβ和lhβ基因在垂体中的表达模式

按照先前的研究(陈华谱等, 2021), 将密斑刺鲀的雌雄性腺分为早、中和晚期共3个时期。通过检测在雌雄性腺发育的不同时期, 垂体中和的表达模式, 发现基因在卵巢和精巢发育成熟过程中的表达量均逐渐下降, 而基因在卵巢和精巢发育成熟过程中的表达量逐渐增加(图8)。

3 讨论

本研究成功克隆了密斑刺鲀和基因cDNA序列, 并推导出其氨基酸序列。结果显示, 密斑刺鲀Fshβ和Lhβ的氨基酸序列中, 都含有一个N-糖基化位点和12个半胱氨酸残基, 具有Fshβ和Lhβ典型的组成结构。一般认为, N-糖基化位点和半胱氨酸残基对于蛋白质结合特异性受体、形成异二聚体结构和蛋白质折叠等方面十分关键(Gharib, 1990)。当Fshβ和Lhβ的序列中N-糖基化位点和半胱氨酸残基发生突变时, 将不能稳定地与GtHα结合并导致其异二聚体结构不稳定(Swanson, 2003; Kim, 2005)。研究发现, 在鱼类中Fshβ氨基酸序列中N-糖基化位点的数量有差异。密斑刺鲀Fshβ只含有一个N-糖基化位点, 与齐口裂腹鱼() (曹洪涛, 2010)和美洲条纹狼鲈(Hassin, 1995)等结果一致, 而在漠斑牙鲆() (柳学周等, 2014)和大菱鲆() (高云红, 2020)中, Fshβ含有两个N-糖基化位点。第二个糖基化位点兼具与受体结合以及增强信号转导活性的功能(Flack, 1994)。根据同源性分析的结果, 密斑刺鲀Fshβ和Lhβ亚基与同为鲀形目鱼类的同源性最高, 与在其他鱼类中的研究相类似(Kato, 1993; Quérat, 2000; Ando, 2004)。此外, 通过构建系统进化树分析, 发现密斑刺鲀Fshβ和Lhβ分别与其他物种的Fshβ和Lhβ聚为一支, 且均与同为鲀形目的物种亲缘关系最近, 与哺乳类的亲缘关系较远, 符合其传统的分类地位与进化关系(黄小琪等, 2020)。但有意思的是, 通过Fshβ和Lhβ亚基的氨基酸序列三级结构分析, 发现从鱼类到哺乳类其Fshβ亚基三级结构非常相似, 而Lhβ亚基的差异较大, 这可能与氨基酸序列差异相关。Lhβ氨基酸序列C-末端区域保守性较高, 但N-末端区域与其他硬骨鱼类和哺乳动物存在较大差异, 猜测是在进化过程中产生了部分氨基酸缺失(黄小琪等, 2020)。

图4 密斑刺鲀与其他物种Lhβ氨基酸序列的多重比对

注: 以上各物种的NCBI登录号:(斑马鱼) AAV31153.1,(高体鰤) XP_022603873.1,(红鳍东方鲀) XP_011601356.1,(黄鳝) XP_020462355.1,(菊黄东方鲀) TWW78441.1,(狼鳗) XP_031694696.1,(尼罗罗非鱼) XP_025753499.1,(小鼠) EDL22853.1,(智人) KAI4043840.1

表5 密斑刺鲀Lhβ与其他物种的同源性

Tab.5 Homology of Lhβ between D. hystrix and other species

根据组织分布的检测结果,和基因在密斑刺鲀各组织中的表达具有显著的差异, 但雌雄个体之间的组织分布情况高度相似, 均在垂体中表达量最高, 其次是性腺。垂体组织是密斑刺鲀分泌促性腺激素最关键的组织, 而多组织表达的特性, 也预示着和基因可能还参与了鱼体内其他的生理过程, 与斑马鱼(So, 2005)、丝鳍毛足鲈() (Jackson, 1999)和金头鲷() (Meiri, 2004)中的研究结果相吻合。此外, 在早期的部分鱼类研究中发现促性腺激素仅在垂体中特异性表达, 不具有广泛分布的特性(Tyler, 1991; Kagawa, 1998a; 牛艳东等, 2008), 可能是由于不同物种间的差异, 或不同的发育状态, 亦或是受限于早期检测技术的较低灵敏度而产生的差异结果。众所周知, 促性腺激素的受体在不同组织中均有广泛的分布, 而促性腺激素作为分泌性蛋白, 可伴随血液循环系统作用到不同组织, 由此, 关于和的其他生理功能仍有待发掘。

密斑刺鲀垂体中和基因在性腺发育不同时期中具有不同的表达模式。在卵巢和精巢发育早期,在垂体组织中具有较高的表达量, 随着性腺的进一步成熟,的表达量逐渐降低, 表明Fsh是密斑刺鲀性腺发育早期起主导作用的促性腺激素类型, 主要调控性腺早期的发育。而在雌雄性腺发育早期, 密斑刺鲀基因在垂体组织中的表达量较低, 但随着性腺发育而逐渐升高, 表明Lh参与调控性腺发育成熟后期。密斑刺鲀和基因在性腺发育过程的表达模式与大刺鳅() (黄小琪等, 2020)和条石鲷(陈圣毅等, 2014)等研究结果相一致, 也和传统的认知相同, Fsh作用于性腺发育的早期, Lh主要作用于性腺发育的后期。但在鱼类中, 关于和基因在性腺发育不同时期的表达同样存在着多样性。在漠斑牙鲆的研究中发现, 垂体中在卵巢发育的早期的表达量较低, 到卵巢成熟时,的表达量显著升高(柳学周等, 2014)。在草鱼(Zhou, 2010)的研究中, 发现和在草鱼性腺发育过程中具有相同的表达模式, 二者共同调控草鱼性腺的发育和成熟。这表明鱼类Fsh和Lh在发挥生殖调控功能中存在着明显的种间差异和生理功能差异。

图5 Fshβ和Lhβ系统进化树

注: 系统进化树中结点处数值代表1000次评估的自举检验置信度; 三角形表示本研究对象

图6 密斑刺鲀和其他脊椎动物Fshβ、Lhβ成熟肽的三级预测结构

注: a. 人Fshβ成熟肽; b. 密斑刺鲀Fshβ成熟肽; c. 红鳍东方鲀Fshβ成熟肽; d. 人Lhβ成熟肽; e. 密斑刺鲀Lhβ成熟肽; f. 红鳍东方鲀Lhβ成熟肽

图7 密斑刺鲀fshβ和lhβ基因在不同组织中的表达

注: a.; b.。数据以平均值±平均标准方差表示(=3), 统计差异表示为*<0.05

4 结论

本研究克隆鉴定了密斑刺鲀和基因的cDNA序列, 并进行了序列及结构分析, 发现Fshβ和Lhβ都含有一个N-糖基化位点和12个半胱氨酸残基, 在硬骨鱼中Fshβ和Lhβ都与同为鲀形目的物种亲缘关系较近。同时, 发现了和在所有组织中均有表达, 在垂体中的表达量最高, 这预示着除了参与性腺发育调控外,和基因在密斑刺鲀中可能参与更多样化的调控过程。此外, 密斑刺鲀垂体中和基因在性腺发育不同时期的表达模式提示, Fsh主要在性腺发育早期起主导作用, 而性腺发育晚期则主要由Lh发挥功能。本研究为密斑刺鲀生殖调控机制研究提供了一定的理论基础。

图8 密斑刺鲀不同性腺发育时期fshβ和lhβ基因在垂体中的表达

注: 垂体中(a)和(b)在不同卵巢发育时期的表达; 垂体中(c)和(d)在不同精巢发育时期的表达。数据以平均值±平均标准方差表示(=5); 上标不同的字母表示组间的显著性差异(<0.05)

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CLONING AND EXPRESSION ANALYSIS OFANDGENE IN

GUO Yu-Wen, LI Yi-Kai, DAI Ming-Shu, LIANG Jun-Hao, HUANG Yan-Lin, LI Guang-Li, CHEN Hua-Pu

(Guangdong Research Center on Reproductive Control and Breeding Technology of Indigenous Valuable Fish Species, Guangdong Provincial Engineering Laboratory for Mariculture Organism Breeding, Fisheries College, Guangdong Ocean University, Zhanjiang 524088, China)

is a well-known economic fish in the South China Sea with high edible and medicinal value. However, studies on the reproduction of.are few, which hinder the development of its artificial breeding. Gonadotropic hormone (GtH) is one of the key hormones for reproductive regulation, and plays a connecting role in the reproductive regulation axis. We cloned the cDNA sequences ofandgenes from.by molecular cloning techniques. Through bioinformatics analysis, we found that the open reading frame (ORF) ofcDNA contains 363 bp, encoding 120 amino acids, while the ORF ofcDNA contains 420 bp, encoding 139 amino acids. Sequence alignment and phylogenetic tree analyses showed that both Fshβ and Lhβ ofare similar to those of fishes of the family Tetraodontidae. According to the tertiary structure analysis, we found that the tertiary structure of Fshβ is highly conservative, while the tertiary structure of Lhβ is moderately conservative. The tissue distribution ofandgenes in.was detected by qRT-PCR. Results show that the expression of bothandwas the highest in the pituitary, followed by the gonads. In addition, we detected the expression patterns ofandgenes during the development of male and female gonads, and found that the expression ofgene in the pituitary gradually decreased with the development of gonads, while the expression ofgene gradually increased. This study provided a theoretic basis for constructing the reproductive regulatory network of.

;;; molecular cloning; expression pattern

* 海南省重点研发计划, ZDYF2018225号; 湛江市科技计划项目, 2022A01214号; 阳江市科技计划项目, 2022011号, SDZX2023027号。郭煜文, 硕士研究生, E-mail: gdougyw@163.com

陈华谱, 博士, 教授, E-mail: chenhp@gdou.edu.cn

2023-04-28,

2023-08-04

S965.3

10.11693/hyhz20230400098

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