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美国《Emerging Infectious Diseases》2021年第11期有关人兽共患病论文摘译

2022-12-28兰莺

中国人兽共患病学报 2022年1期
关键词:谱系阳性率耐药

P2753 韩国冠状病毒病流行控制、卫生系统和疾病负担缓解措施的政策性回顾和建模分析//Hae-Young Kim, In-Hwan Oh, Jacob Lee,等

我们回顾了韩国控制冠状病毒病流行的关键政策时间表,并确定这些政策对疫情和医院负担的影响。通过离散随机传播模型预测,我们估算包括广泛检测、接触者追踪和检疫在内的多级政策将接触率降低了90%,并在2020年2月至3月期间,使大邱和全国的疫情迅速下降。如果没有这些及时的应对措施,到2020年5月15日,与现状相比,感染、住院和死亡人数可能会增加10倍以上。该模型表明,将轻度或无症状患者重新分配到社区治疗中心有助于避免医院超负荷工作,并使医护人员能够在医院里和负压重症监护病房里为更为危重的患者提供护理。由于小规模疫情持续发生,需要追踪接触者并保证医院的容纳能力。

P2761 雅培BinaxNOW快速抗原检测在美国加利福尼亚州赛马场员工SARS-CoV-2感染暴发中检测的有效性//Krishna Surasi, Kristin J.Cummings, 等

在检测严重急性呼吸综合征冠状病毒2方面,雅培BinaxNOW快速抗原试验比实时逆转录PCR(rRT PCR)更便宜、更快。在美国加利福尼亚州赛马场员工冠状病毒病暴发感染期间,我们比较了342人的769对样本的BinaxNOW与rRT-PCR检测结果,阳性符合率为43.3%(95%CI:34.6%~52.4%),阴性符合率为100%(95%CI:99.4%~100%),阳性预测值为100%(95%CI:93.5%~100%),阴性预测值为89.9%(95%CI:87.5%~92.0%)。在127例rRT-PCR阳性标本中,55例配对BinaxNOW阳性结果的平均循环阈值(Ct值)低于72例配对BinaxNOW阴性结果的平均Ct值(17.8vs28.5;P<0.001)。在100例Ct值<30的标本中,共有51例病毒分离阳性;其中45例(88.2%)为BinaxNOW阳性。我们的比较结果,支持立即隔离BinaxNOW阳性人群,并对阴性人群进行验证性检测。

P2786 基于概率估算的美国犹他州SARS-CoV-2血清阳性率及检测分数//Matthew H.Samore, Adam Looney, Brian Orleans, 等

我们的目的是对美国犹他州4个城市化县的严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)感染率进行无偏估计。我们采用多阶段抽样设计,随机选择年龄>12岁的社区代表性参与者。在2020年5月4日至6月30日期间,我们收集了5 125户8 108人的血清样本和调查结果。我们使用定性化学发光微粒子免疫分析法检测血清样本中的SARS-CoV-2 IgG。我们估计总体血清阳性率为0.8%。估计血清阳性率与病例的计数比为2.5,相当于40%的检出率。我们收集的鼻咽拭子样本,只有0.2% SARS-CoV-2 RT-PCR结果呈阳性。研究期间SARS-CoV-2抗体流行率较低,PCR阳性病例的流行率更低。相对较高的SARS-CoV-2检出率(40%)证明了犹他州检测策略和公共卫生应对措施的有效性。

P2795 2020年法罗群岛接受隔离的COVID-19病例密接者中SARS-CoV-2特异性抗体的血清阳性率//Maria Skaalum Petersen, Marnar Fríeheim Kristiansen, Halla Weihe Reinert,等

冠状病毒病(COVID-19)患者的密切接触者感染SARS-CoV-2的风险很高。我们评估了法罗群岛冠状病毒病隔离检疫的病例密接者中SARS-CoV-2特异性抗体的血清阳性率。我们招募被隔离的密切接触者参与此项研究,他们是在2020年3月3日至4月22日期间确诊的COVID-19指示病例的密切接触者。584名(81%)接触者同意并接受了血清学检测。在584名参与者中,有32例(5.5%)SARS-CoV-2总抗体呈血清学阳性。与其他接触者相比,家庭成员和年幼或年长的接触者血清阳性的风险更高,续发率为19.2%。密切接触者的血清阳性率几乎是法罗群岛普通人群的10倍。定期对COVID-19患者的家庭密切接触者开展检测,可能有助于追踪SARS-CoV-2的传播。

P2802 加拿大英属哥伦比亚2021年1月至4月SARS-CoV-2 P.1谱系的快速增加导致与 B.1.1.7谱系的共显性//Catherine A.Hogan, Agatha N.Jassem,Hind Sbihi, 等

2020年末出现了几种值得关注的SARS-CoV-2变异株(VOCs),最初是B.1.1.7谱系在全球占主导地位。然而,B.1.351谱系和P.1谱系才是潜在的更严重的传播和免疫逃逸风险。B.1.1.7和B.1.351于2020年12月首次在加拿大英属哥伦比亚省被发现,而P.1则首次发现于2021年2月。我们结合定量PCR和全基因组测序,以评估2021年前16周在英属哥伦比亚省近67 000例感染者中VOCs的相对贡献。B.1.1.7谱系在早期筛查或测序样本中占比<10%,到第8周增长到>50%。P.1在第10周之前占比一直<10%,在第12周迅速增加至峰值,到第13周趋于稳定,与其他谱系共存,占所有VOC病例的<10%。B.1.351始终占比较少。P.1的快速增长和B.1.351的增速降低,扩展了我们对人群水平VOC模式的理解,并可能为新出现的VOCs的适应度决定因素提供线索。

P2817 美国献血者的甲型肝炎病毒感染率和生物标记物动力学//Stephanie Schoch, Martin Wälti, Mathias Schemmerer, 等

美国目前受到广泛暴发的甲型肝炎病毒(HAV)影响。我们调查了自2016年以来,美国献血者中的甲型肝炎病毒感染率。对甲型肝炎病毒阳性的频繁捐赠者连续捐献的血液进行常见生物标志物分析,以获得感染过程的详细图像。我们发现随着时间的推移,随着疫点的转移,感染率显著增加。尽管个体生物标记物谱高度变异,但HAV RNA通常具有高峰和双相下降,并且常在数月内可持续检出。每个捐赠者都有一个指示先前的暴露情况的生物标记物模式。我们的研究结果表明,目前的甲型肝炎疫情已经蔓延到献血人群中。展示的详细结果提高了我们对甲型肝炎感染和相关公共卫生方面的理解。此外,对RNA曲线的完整描述可以估计甲肝病毒倍增时间。

P2847 缅甸结核分枝杆菌菌株的基因组分析//Htin Lin Aung, Wint Wint Nyunt, Yang Fong, 等

多药耐药性是全球消灭结核病(TB)的主要威胁。我们在2016年7月至2018年6月,从缅甸仰光确诊的342名结核患者中分离到309个分离株,后进行表型药敏实验和全基因组测序。我们使用GeneXpert平台鉴定分离株,以评估耐药情况。309株分离株中有191株(62%)对利福平耐药;这些利福平耐药株中有168株(88%)基因组间不相关,提示是人群中耐药情况的反复发生,而非广泛的局部传播。我们未发现贝达喹啉和普瑞托曼等新型口服药物的耐药突变。GeneXpert MTB/RIF现行系统需要使用新推出的Xpert MTB/XDR方法或线性探针技术进行调整。引进新的口服药物取代目前耐多药结核的治疗方案中使用的药物,也将有助于缅甸结核病的治疗。

P2856 英国某康复中心野生哺乳动物感染高致病性禽流感病毒A(H5N8)后致脑炎和死亡的情况//Tobias Floyd, Ashley C.Banyard, Fabian Z.X.Lean, Alexander M.P.Byrne, 等

我们报告一起2020年末在英国一家野生动物康复中心发生的天鹅、海豹和狐狸的疾病和死亡事件。5只天鹅在圈养期间感染了高致病性禽流感病毒。随后,5只海豹和1只狐狸在临床疾病发作后死亡(或被安乐死)。经回顾性调查,确定该病由甲型禽流感病毒H5N8亚型引起。海豹感染表现为癫痫样症状,尸检样本免疫组化和分子检测发现病毒产物的神经分布。狐狸突发食欲不振后一夜死亡,尸体组织显示病毒产物分布于神经和呼吸系统。从天鹅、海豹和狐狸中分离出活病毒,在哺乳动物源的病毒序列中检测到一种潜在的适应性突变。在事件发生后的几周内,未报告人类流感样疾病。

(福建省疾病预防控制中心 兰 莺 译)

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