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环状RNA与支气管哮喘相关性研究

2022-11-23杨贤苗钱粉红

关键词:气道支气管哮喘

杨贤苗,钱粉红

江苏大学附属医院呼吸与危重症医学科,江苏 镇江 212000

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一类新近发现有重要作用的共价闭合环状非编码RNA。最初被认为是转录过程中异常剪接的副产品。2013年发表在《自然》杂志上的一篇文章提出,circRNA 可以充当微小RNA(microRNA,miRNA)海绵发挥重要的作用,从此circRNA 成为非编码RNA 领域的研究热点[1]。circRNA参与许多疾病的发生发展过程,在肿瘤领域的研究相对集中[2]。支气管哮喘简称哮喘,是由多种细胞及其组分参与的慢性气道炎症,目前其发病机制尚不明确。相关研究指出circRNA在先天免疫、炎症反应中发挥重要的作用[3-4]。本文结合circRNA 领域最新研究成果,就其与哮喘的密切关系作一综述。

1 circRNA概述

1.1 circRNA的主要特点和分类

circRNA 是一类特殊的非编码RNA 分子,与传统的线性RNA(含5′帽结构及3′多聚腺苷酸尾结构)不同,circRNA 将5′和3′末端共价连接呈封闭环状结构,使其不易被核苷酸外切酶降解,在细胞中稳定存在,表达丰富,具有进化的保守性及组织特异性[5-8]。circRNA 主要有以下4 种亚型:外显子circRNA(ecircRNA)、内含子circRNA(ciRNA)、外显子-内含子circRNA(EIciRNA)以及其他非经典的circRNA,如tRNA 内含子circRNA(tricRNA)、病毒circRNA等。

1.2 circRNA的生物学功能

circRNA 的细胞定位在一定程度上决定其行使的功能。ciRNA、EIciRNA 主要位于细胞核内,能与RNA聚合酶等相互作用,在转录水平上调节基因的表达[9]。主要分布于细胞质的ecircRNA,其可能来自细胞核向细胞质的定向运输,也可能来源于核膜破裂时的主动逃逸,通过竞争性结合miRNA,在转录后水平调控靶基因表达。circRNA通过与RNA结合蛋白结合,在一定程度上影响线性RNA的生成和功能,也可通过充当蛋白间的支架,调节蛋白的修饰和降解,调节下游细胞信号转导通路[10-11]。同时,蛋白质因子能够诱导特定circRNA 的环化,发挥稳定剪接序列和抑制典型的线性剪接的双重作用[2]。此外,circRNA 虽为非编码RNA,但部分circRNA 也能够被翻译成短肽[12]。人类circRNA 中N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰可以驱动翻译,且有数百个内源性circRNA具有翻译潜能[13]。目前越来越多证据表明circRNA参与哮喘发病的表观遗传学机制,从而影响哮喘的一系列病理生理过程。

2 circRNA与哮喘的相关性研究

2.1 circRNA与先天免疫

先天免疫细胞如先天性淋巴样细胞(ILC)和树突状细胞(DC)在受到致敏原刺激后募集到肺部,引起肺部炎症以及免疫异常是化学性哮喘的发病机制之一。circSnx5 能减轻miR-544 介导的负向调控SOCS1 及PU.1 的核转运作用,调控DC 的激活以及免疫原性[14]。巨噬细胞能够通过释放炎性介质以及与其他细胞相互作用来参与气道炎症。有研究报道[15-16],circRNA 可能参与巨噬细胞的活化及免疫应答。关于circRNA 调控先天免疫目前有以下两种机制。双链RNA 依赖的蛋白质激酶(doublestranded RNA-dependent protein kinase,PKR)是细胞经干扰素诱导产生的一种蛋白激酶,有较为保守的双链RNA 结合结构域,在双链RNA 的激活下可阻止蛋白质合成,抑制病毒的复制和肿瘤细胞的生长。而76%的circRNA 能够在细胞中形成16~26 bp的双链RNA。这种较短的双链RNA 与PKR 结合后,可以阻断PKR 的激活,从而抑制先天免疫反应[3]。Chen 等[17]提出,外源性circRNA 可以充当抗原诱导体内抗原特异性T 细胞活化、抗体产生和抗肿瘤免疫。m6A 修饰可以降低外源性circRNA 的免疫原性,从而抑制先天免疫。先天免疫的损伤与干扰素的释放以及抗病毒反应有关。研究发现1 型、3 型干扰素的缺失与下呼吸道病毒感染是儿童哮喘发生发展的重要危险因素[18]。哮喘是一种慢性气道炎症性疾病,辅助性T 细胞亚群功能紊乱是哮喘免疫异常的重要机制,这种病原体与宿主的相互作用可能激活适应性免疫反应导致Th1/Th2 失衡以及Treg/Th17 失衡,从而参与哮喘的发生发展[19]。上述两种circRNA 对先天免疫的调控机制提示了circRNA可能在机体对外界刺激做出先天免疫应答中具有重要的作用。那么从circRNA 水平出发,通过调控circRNA表达以及表观遗传修饰可能提高机体先天免疫的能力,从而规避哮喘发生的风险,预防哮喘的发生发展。

2.2 circRNA与环境因素

哮喘的发病是遗传因素和环境因素共同作用的结果。环境因素的刺激可导致表观遗传学的改变,从而影响某些基因的激活[20]。在与空气直接接触的气道上皮中存在许多哮喘易感基因,其中支气管上皮在哮喘的发生发展过程中发挥重要作用,Th2细胞及其细胞因子可以降低哮喘患者支气管上皮细胞连接的完整性[21],使上皮细胞的屏障功能被破坏,在受到过敏原、空气污染物以及病原微生物等刺激时,支气管上皮细胞产生炎症反应和异常的修复反应是哮喘气道高反应性和气道重塑的重要机制[22]。研究表明空气中PM2.5 浓度升高,可加重哮喘患者喘息和呼吸困难的症状,但其具体的机制尚不明确[23]。Jia 等[24]研究发现circRNA406961 在PM2.5介导的支气管上皮炎症反应中可能与白介素增强子结合因子相互作用,通过激活STST3/JNK 通路下调炎症因子白介素(interleukin,IL)-6及IL-8的表达来发挥抑制炎症的作用。薛海南等[25]研究发现稀土氧化钕染毒组的人支气管上皮细胞(human bronchial epithelial cell,16HBE)分泌的炎症因子较对照组明显增高,对80 μg/mL处理组的细胞微阵列RNA 测序结果显示有1 263 种circRNA 差异性表达。选取5 个上调和5 个下调的circRNA 用实时荧光定量PCR 验证结果与芯片的趋势一致。其中下调趋势最明显的hsa_circRNA_0080083 与氧化钕的浓度呈线性负相关。Hua 等[26]研究了circRNA 0039411在稀土氧化钕介导的16HBE炎症反应和功能障碍中的作用和机制。circRNA 0039411 可以充当miR-93-5p的海绵,通过miR-93-5p/STAT3通路来调节炎症因子IL-6和IL-8的表达水平以及影响上皮细胞周期来调控上皮细胞的增殖。同时,用二氧化钛处理16HBE对circRNA 0039411的表达并无明显影响。circRNA与支气管上皮的炎症有一定的相关性,在不同的刺激原作用下,circRNA可能存在特异性的表达,不同的circRNA 对支气管上皮炎症反应发挥促进或者抑制的不同作用,circRNA 有望成为反映支气管上皮炎症及其严重程度的生物标志物。

2.3 circRNA与miRNA网络

近年来miRNA 在转录后水平调控基因表达的机制较为明确。miRNA是一种长度约20~25个核苷酸的具有调控功能的非编码RNA,与靶基因mRNA的3′-UTR区域碱基互补配对,进而抑制靶基因的表达[27]。许多研究表明miRNA与哮喘关系密切,可作为哮喘的诊断指标,也可预测哮喘的严重程度,例如miRNA-21通过靶向10号染色体上的磷酸酶和张力素同源物抑制PI3K-AKT 通路,促进气道平滑肌细胞增殖,参与气道重塑,同时血清中miRNA-21表达水平对类固醇敏感和类固醇抵抗型儿童哮喘的鉴别具有预测价值。miRNA-155 和let-7miRNA 有助于儿童哮喘的诊断及严重程度的预测等[28-32]。部分非编码RNA 能够通过竞争性与miRNA 结合形成miRNA反应元件,从而减弱miRNA对靶基因的负性调控,也称ceRNA机制[33-35]。目前,关于circRNA在哮喘中的直接研究较少,但是上述很多研究表明circRNA 可能通过ceRNA 机制参与哮喘的发生发展。发挥这类竞争性交互作用的circRNA 大多为ecircRNA,它由一个或多个外显子环化而成,在细胞质内有一定丰度且稳定存在,具有物种保守性及组织特异性,但具有miRNA结合位点的ecircRNA只占少数,并且只有当ecircRNA与miRNA的表达水平处于近似数量级时,这种竞争性的交互作用才不会被弱化[36]。由屋尘螨诱导构建的哮喘小鼠模型中鉴定了280个差异表达的circRNA,利用miRanda算法预测构建circRNA-miRNA 互作网络,提示差异表达的circRNA 可能与miRNA 竞争性结合,通过“自身免疫性疾病”“细胞黏附分子”和“吞噬作用”等过程参与哮喘的发生[37]。Shang等[38]研究发现用脂多糖处理的巨噬细胞与脂肪源性干细胞分泌的外泌体共培养,过表达mmu_circ_0001359 可以通过海绵miR-183-5p 靶向FoxO1 转录因子促进M1 型巨噬细胞向M2型巨噬细胞转化,抑制气道炎症反应,减轻气道重塑。circHIPK3能够作为miR-326的海绵,靶向基质相互作用分子1(stromal interaction molecule 1,STIM1)调节气道平滑肌细胞的增殖、迁移及凋亡参与哮喘的气道重塑[39]。Huang等[40]对哮喘患者CD4+T细胞进行微阵列分析发现了有597 个差异表达的circRNA,hsa_circ_0005519 在哮喘患者CD4+T 细胞中上调变化≥3.7倍。随后另一个样本中通过实时荧光定量PCR、荧光素酶报告试验、干扰等方法发现hsa_circ_0005519 可以通过海绵吸附hsa-let-7a-5p来上调IL-6和IL-13的表达。该研究发现哮喘患者CD4+T 细胞中高表达的hsa_circ_0005519 与较高水平的呼出气一氧化氮(fractional exhaled nitric oxide,FeNO)、外周血嗜酸性粒细胞比例相关。hsa_circ_0002594 在哮喘患者CD4+T 细胞中高表达,且在有哮喘高危因素的人群中有相对更高的表达,经皮质类固醇激素治疗后hsa_circ_0002594 表达降低[41]。上述研究表明circRNA可能成为哮喘诊断和治疗的潜在生物标志物。在很大程度上circRNA在哮喘发生发展过程中的作用还不明确,大样本的验证研究相对较少。但随着高通量技术及生物信息学技术的高速发展,以ceRNA 机制作为理论依据构建circRNA-miRNA互作网络也许可以为哮喘表观遗传学研究提供更清晰、有脉络的参考。

3 总结与展望

circRNA 在真核生物体内广泛稳定存在且保守性较高,其在骨关节炎、类风湿性关节炎、糖尿病等慢性炎症性疾病中发挥着重要的作用[42-44]。目前许多研究表明circRNA 参与了哮喘的发病过程,如调控免疫反应、支气管上皮炎症反应以及气道重塑过程等,对哮喘的预防、诊断、治疗均有重要意义,但目前尚缺乏相关的临床研究评估circRNA 与哮喘患者临床数据的相关性。circRNA 通过海绵吸附miRNA 调控靶基因的表达只是其发挥作用的一种机制,circRNA 的其他生物学功能是否参与哮喘的发病仍需更多针对性的研究。随着不断深入地研究,circRNA 有望成为哮喘诊断标志物及治疗的新靶点。

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