澜沧裂腹鱼4个地理群体遗传多样性分析
2022-09-21金方彭左鹏翔吴俊颉熊合勇高海涛雷春云李光华
金方彭,左鹏翔,冷 云,吴俊颉,熊合勇,高海涛,雷春云,周 睿,李光华
( 1.云南省渔业科学研究院,云南 昆明 650000;2.华能澜沧江水电股份有限公司,云南 昆明 650000 )
澜沧裂腹鱼(Schizothoraxlantsangensis),俗称面鱼,属鲤形目鲤科裂腹鱼亚科裂腹鱼属,为高原山区冷水性鱼类,分布于澜沧江中上游。分布区较狭窄,数量不多,已列为《中国物种红色名录第一卷》濒危物种[1]。近年来,由于澜沧江梯级水电站的开发建设导致流域出现片段化,阻碍了澜沧裂腹鱼的自然繁殖,导致自然资源量下降,而通过人工繁殖的方法进行资源量恢复的效果尚不明显。目前,国内外对澜沧裂腹鱼的研究较少,主要集中在繁殖生物学[2]、肌肉营养[3]等方面,有关澜沧裂腹鱼遗传多样性方面的报道较少。以高通量测序为基础的简化基因组测序(SLAF-seq)技术具有通量高、有效读长长、准确度高、重复性好、成本低等特点[4]。马海鑫[5]基于SLAF-seq技术对弧唇裂腹鱼(S.curvilabiatus)进行了群体遗传学分析,王凤娇等[6]基于SLAF-seq技术对中国明对虾(Fenneropenaeuschinensis)3个选育世代进行了遗传多样性分析,金方彭等[7]利用SLAF-seq技术对澜沧江中上游光唇裂腹鱼(S.lissolabiatus)4个地理群体进行了遗传多样性分析。笔者利用SLAF-seq技术获得大量特异性单核苷酸多态性标签,并利用开发的位点分析不同地理群体样品的遗传多样性,为澜沧裂腹鱼未来的种质选育提供数据支持。
1 材料与方法
1.1 样品采集
在澜沧江中上游采集澜沧裂腹鱼野生群体40尾,划分为4个地理群体(表1)。取野生样本尾鳍,存放于无水乙醇中带回实验室后于-85 ℃冰箱保存。……
