富 贵，刘 晶，李军乔*

密花香薷叶绿体基因组结构及系统进化分析

富 贵1, 2, 3，刘 晶1，李军乔1, 2, 3*

1. 青海民族大学生态环境与资源学院，青海 西宁 810007 2. 青海省生物技术与分析测试重点实验室，青海 西宁 810007 3. 青海民族大学 青藏高原蕨麻研究中心，青海 西宁 810007

基于高通量测序获得药用资源植物密花香薷叶绿体基因组序列，分析了叶绿体基因组结构及特征，为研究密花香薷资源分类及系统进化奠定了基础。以密花香薷叶片为材料，利用改良的CTAB法提取DNA；采用二代测序技术Illumina NovaSeq平台对叶绿体基因组进行测序；以广藿香叶绿体基因组为参考序列，进行序列组装和矫正，得到完整叶绿体基因组序列；利用生物信息学方法分析密花香薷叶绿体基因组特征并进行系统发育分析。获得密花香薷完整叶绿体基因组序列全长149 095 bp，GC含量37.92%，注释到130个基因，其中包括85个蛋白质编码基因，8个rRNA基因和37个tRNA基因；密花香薷叶绿体基因组中共检测到28个散在重复序列，串联重复序列共检测到191个，单核苷酸重复序列最多，共114个；系统发育结果表明，密花香薷和其他唇形科植物聚合在一起形成一个分支结构，紫苏属植物和香薷属植物亲缘关系较近。建立了适于香薷属植物叶绿体基因组测序及其特征分析的方法，丰富了唇形科植物遗传资源，为密花香薷分子标记开发及唇形科属种间系统发育分析研究提供了理论基础。

密花香薷；叶绿体；基因组；分子标记；系统发育

叶绿体是绿色植物特有细胞器，是细胞能量转换和储存的场所，遗传方式以母系为主，所以在植物中具有种的特异性，其自身拥有一套完整的基因组，重组率低，后代遗传稳定[1-2]。……