温郁金中茉莉酸氨基酸合酶关键基因JAR的克隆及生物信息学分析
2022-03-21张金华任仙樱喻明军吴志刚姜程曦
李 帆,薛 畅,张金华,任仙樱,喻明军,吴志刚,姜程曦
温郁金中茉莉酸氨基酸合酶关键基因的克隆及生物信息学分析
李 帆1,薛 畅2#,张金华3,任仙樱4,喻明军5,吴志刚2*,姜程曦1*
1. 温州大学生命科学研究院,浙江 325035 2. 温州医科大学药学院,浙江 温州 325035 3. 大理药业股份有限公司,云南 大理 671000 4. 温州莪金医药有限公司,浙江 乐清 325600 5. 安徽环球基因科技有限公司,安徽 滁州 239004
克隆温郁金茉莉酸氨基酸合酶关键基因(JA-amino acid synthetase)的全长cDNA序列,并进行生物信息学和表达分析。根据温郁金转录组数据设计特异性引物。以温郁金根茎的cDNA为模板,通过RT-PCR扩增获得全长cDNA序列,利用生物信息学软件预测基因编码蛋白的特征;利用ClustalW和MEGA 6.06软件构建温郁金的系统进化树;构建原核表达载体PET-22B(+)-JAR,纯化重组蛋白JAR5,并进行鉴定。扩增后的基因编码582个氨基酸,全长1749 bp,且具有典型的GH3特征结构域,不具跨膜域,不存在信号肽,属于不稳定蛋白;PCR扩增后得到约1 800 bp大小的片段,经凝胶过滤色谱纯化,最终得到基于蛋白印迹实验(Western blotting)验证正确的66 200大小的重组蛋白。首次克隆并分析了温郁金基因,纯化了JAR5蛋白,为进一步研究温郁金基因蛋白功能研究提供依据。
温郁金;基因;基因克隆;JAR5;蛋白纯化
温郁金Y. H. Chen & C. Ling系姜科姜黄属药用植物,其根茎、块根均可供药用,为《中国药典》2020年版收载品种[1],是浙江省著名道地药材,属“浙八味”之一[2]。现代药理与临床研究表明温郁金主要有效成分为萜类和姜黄素类[3-5],具有抗肿瘤、抗血栓、保肝、抗过敏等多种药理活性[6-7]。
JA-amino Acid Synthetase()为编码茉莉酸氨基酸合酶的重要基因,是植物响应茉莉酸途径的重要基因[8]。……
