蔡一鸣，代江鹏，郑雨欣，任英毅，陈浩明，冯婷婷，高晓霞，朱 爽*

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钩藤属植物分子鉴定的DNA条形码筛选

蔡一鸣1，代江鹏1，郑雨欣1，任英毅1，陈浩明1，冯婷婷1，高晓霞2，朱 爽1*

1. 广东药科大学生命科学与生物制药学院 广东省生物技术候选药物研究重点实验室，广东 广州 510006 2. 广东药科大学药学院 广东 广州 510006

应用分子生物学鉴定技术，筛选出应用于鉴定钩藤属物种的最佳DNA条形码，建立快速、准确、便捷的钩藤属植物鉴定方法。从广东、广西等地收集了8个钩藤属物种的叶片、茎枝作为材料，共计44份样品。提取样品总DNA，分别对条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列进行扩增、测序、拼接、校对；利用 MEGA 7.0分析比对序列特征；基于TaxonDNA计算种内、种间的遗传距离以分析barcoding gap及Best Match、Best Close Match评估DNA条形码的鉴别能力；使用MEGA7.0、Phylosuite等软件构建单条形码及组合条形码的最大似然法（maximum likelihood，ML）、最大简约法（maximum parsimony，MP）、贝叶斯推断法（bayesian inference，BI）系统发育树。条形码ITS、matK、psbA-trnH、rbcL、trnL-trnF序列均扩增成功且具有较高的测序成功率，其中psbA-trnH具有最多的变异位点，ITS次之，rbcL最少；Best Match、Best Close Match与Barcoding gap分析结果显示：5个单一条形码中，ITS鉴定钩藤属物种效果突出且具有明显的Barcoding gap，而组合条形码ITS＋rbcL序列表现更为优异。基于所有单一条形码构建的系统发育树，ITS序列的物种鉴别成功率最高，能够准确鉴定8个钩藤属物种；基于组合条形码构建的系统发育树，ITS＋rbcL序列具有最高的平均节点支持率，且该序列集包含的11个钩藤属物种均能单独聚为一支。应用ITS＋rbcL的序列组合能够实现钩藤属不同物种的准确鉴定。

钩藤属；DNA条形码；物种鉴定；……