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2018-2020年克拉玛依市甲型H3N2流感病毒分子特征分析

2022-03-18李金鞠

中国人兽共患病学报 2022年2期

刘 佳,李金鞠

流行性感冒(简称流感)是由流感病毒引起的上呼吸道传染性疾病,对健康的危害极大,是世界卫生组织列为实行全球监测的首要传染病。流感病毒属于正粘病毒科流感病毒属,由分8个节段的单股负链RNA组成,外部有包膜。根据核蛋白的抗原性分为甲、乙、丙、丁4个型别,根据血凝素(Hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)蛋白的抗原性差异,甲型流感病毒又可以分为多种亚型,目前人群中流行的主要是新甲型H1N1,H3N2,乙型Victoria与乙型Yamagata 4种亚型[1]。自1968年香港暴发H3N2流感大流行后,H3N2型流感病毒已成为流感流行的主要病原之一[2]。HA 和NA作为流感病毒主要表面抗原,是引起流感病毒发生抗原性漂移的主要因素,在病毒感染和传播过程中起着至关重要的作用。本研究通过分析2018-2020 年克拉玛依市H3N2流感病毒HA和NA基因的变异情况,及时掌握本地流感病毒流行动态和进化方向,为H3N2 的防治工作提供参考数据。

1 材料与方法

1.1 样本来源 采集2018年1月至2020年12月哨点医院流感样病例咽拭子2 073份,经Real-Time PCR鉴定127份为H3N2,20株用MDCK细胞完成病毒分离培养,其中18株测序成功(2018年初毒株2株,2019年底毒株9株,2020年初毒株7株)。

1.2 基因扩增和测序测定 采用Sanger测序方法测定HA和NA基因序列。上海伯杰生物有限公司负责完成此次扩增及测序工作。

1.3 基因序列比对及进化树构建 将WHO推荐的2017-2018年北半球H3N2流感疫苗株A/Hong Kong/4801/2014、2019-2020年北半球H3N2流感疫苗株A/Kansas/14/2017以及2013-2019年国内其他省份部分H3N2流感分离株作为参比序列,采用Mega多功能基因分析软件将已测定序列的分离株同参比序列进行比对和分析,比较其基因同源性、受体结合位点和糖基化位点。……

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