致病性钩端螺旋体的多位点序列分型研究
2022-03-18杜宗利辛晓芳徐颖华
李 喆,张 影,杜宗利,辛晓芳,叶 强,徐颖华
钩端螺旋体病(简称钩体病)是由致病性钩端螺旋体(简称钩体)引起的人兽共患传染病[1]。尽管随着经济的发展和卫生条件改善,在过去几十年世界各国钩体病的发病率大幅降低,但据WHO统计,每年仍有约200万钩体感染病例,一些地区甚至还发生暴发流行。因此,钩体病仍是当前全球的重要公共卫生问题[1-2]。
病原体的监测和溯源是预防和控制传染性疾病的最关键步骤之一。国际和国内对钩体菌株的分类从最早血清学分类法,到各型不同原理的分子分型方法[3-5]。随着分子生物学的发展,自20世纪90年代起,研究人员就开始应用16SRNA基因测序方法对钩体进行分子分型,并将致病性钩体中包括问号(Leptospirainterrogans)、波氏(L.borgpetersenii)、卫氏(L.weilii)等10个基因种[6-7]。此外,Ahmed等[8]于2006年首次将基于多种管家基因的多位点序列分型法(Multi-Locus Sequence Typing, MLST)技术用于钩体的分子分型,由于该方法简单、快捷、结果易于比较,被广泛用于不同致病性基因型的分子分型、进化溯源和种群结构等研究[9-10]。而目前对全球致病钩体菌株进行系统性MLST分析的研究较少。此外,中国致病性钩体菌株MLST研究多用于黄疸出血群的型群结构分型[6,9],而其他血清群致病性钩体分型和遗传多样性的研究报道也较少。因此,在本研究应用16SRNA基因测序和MLST分析方法对不同来源、不同时期的21种不同血清群的国内钩体分离菌株与国际参考菌株进行分析,并与国内7株疫苗株结果平行比较[4]。同时基于PubMLST数据库和已有的文献报道[4,6,9],共收集来自世界7大洲不同国家和不同时期1 238株致病性钩体基因种和MLST数据(含236株中国致病性钩体MLST数据)。……
