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两头乌猪JAZF1基因的克隆及生物信息学分析

2022-01-13徐兴莉饶荣海

猪业科学 2021年12期

杨 虎 ,徐兴莉 ,饶荣海

(1.宜春学院生命科学与资源环境学院,江西 宜春 336000;2.宜黄县桃陂镇兽医站,江西 抚州 344400)

JAZF1(Ju xtaposed with another zinc finger gene1)基因又名Tip27,ZNF802,最早由全基因组关联研究发现的与人Ⅱ型糖尿病相关的基因,JAZF1基因对动物糖和脂肪代谢有重要调控作用。卢春敏等将JAZF1基因转染到小鼠肝细胞,发现JAZF1基因过表达可以使SREBP1基因表达下调,而SREBP1基因表达产物是脂肪代谢调控的重要转录因子,这些转录因子的调控直接影响脂肪的合成。通过对小鼠研究发现,JAZF1基因过表达能够显著抑制肝脏的糖异生作用。这些研究表明JAZF1是体内脂代谢和糖代谢的重要调控因子。JAZF1基因在动物体内对脂肪代谢分子调控机制还不清楚,而脂肪含量特别是肌内脂肪和肌间脂肪含量是评价动物肉质的重要指标。文章以肌内脂肪含量适中的赣西两头乌猪为研究对象,克隆JAZF1基因的cDNA全长,并对该序列的组成、编码蛋白质的特点进行了生物信息学分析,为探索JAZF1基因调控脂肪代谢机制提供基础。

1 材料与方法

1.1 实验材料

组织样品取自赣西两头乌猪的背最长肌,且保存于-80 ℃,5'RACE和3'RACE克隆试剂盒分别购自Invitrogen公司和 Clontech 公司。

1.2 实验方法

1.2.1 总RNA提取及cDNA 合成

用反转录酶和特异性引物先合成cDNA第1链,然 后 用RNase Mix 对cDNA处理,最后再纯化cDNA。

1.2.2 PCR扩增

根据GenBank提供的人JAZF1基因(登录号:NM_175061)序列设计PCR引物(表1)扩增并克隆测序,即可获得JAZF1基因部分CDS(coding domain sequence)序列。

表1 引物序列

1.2.3 RACE扩增

1)5'RACE扩增。首先对纯化后的cDNA末端加上多聚C,再用试剂盒特异性引物对已经加尾的cDNA进行第一轮扩增;再用特异性引进行第二轮扩增,电泳检测扩增产物进行并回收,最后将PCR产物与pMD18-T连接,并进行测序,得到长度为684 bp的目的序列。……

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