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增强采样副本交换分子动力学研究端基对Tau74蛋白结构特征的影响

2021-12-25石虎姚泽帅

山西大学学报(自然科学版) 2021年5期
关键词:体系区域结构

石虎,姚泽帅

(山西大学 化学化工学院,山西 太原,030006)

0 引言

阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD),又名老年痴呆症,是一种常见的神经退行性疾病[1]。临床上有两种表现:(1)细胞外的淀粉样斑块沉积,其主要成分为 β-淀粉样蛋白[2-3];(2)细胞内纤维状缠结,其主要成分为Tau蛋白[4-5]。Tau蛋白属于微管相关蛋白家族。它们主要在神经元中表达。在微管蛋白单体组装成微管构成神经元微管网络中起重要的作用。AD患者神经细胞中,Tau蛋白发生聚集是导致神经细胞萎缩和死亡的主要原因[6]。因此,要理解Tau蛋白的聚集过程就需要探索Tau蛋白的结构性质。

与微管结合的Tau蛋白是本质无序蛋白,同时具有很好的可溶性,其在人体中枢神经系统中大量存在[7]。Tau的结构如示意图1A所示,包含N端、酸性区、脯氨酸富集区域、重复(Repeat)区域和C端。在全长的Tau蛋白中,N末端和C末端都是高度无序结构[8]。Repeat区域是整个Tau蛋白中最关键的区域,其原因在于repeat结构特征不但与tau蛋白-微观结合相关,而且与致病纤维状聚集有关[9-12]。对于纤维聚集体的实验研究显示,Tau聚集体的β-sheet核心也就集中在repeat区域[13-14]。

Repeat区域分为R1、R2、R3和R4四个区域,其中R2区域也可以出现缺失状态。现有的研究表明,repeat区域的结构特征也趋向于自由卷曲状态[15-17]。作者Huan He独立的R1~R4的单体模拟研究显示:R1、R2和R4取向螺旋结构,而R3则倾向于折叠结构[18]。二级结构的结构特征如示意图1B所示。LI对R3在不同组氨酸异构条件下的模拟结果显示:R3片端为非集中结构特征,其聚类最高值在 2.4%(εε)、10.8%(εδ)、1.0%(δε)和 10.6%(δδ)[19]。模拟结果上的差异可能来源于对端基处理的不同,因此,本论文将选取Tau蛋白尿片段并探索其在不同端基条件下的结构性质差异。……

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