病理图像纹理分析在胃癌MSI预测中的应用研究
2021-12-21安卫超
安卫超,阎 婷,张 楠,张 杉,相 洁,曹 锐,王 彬
1.太原理工大学 信息与计算机学院,山西 晋中030600
2.山西医科大学 转化医学研究中心,山西 晋中030600
胃癌是全球最常见的恶性肿瘤之一,2018年全球胃癌新发病例1 033 701例,占全球癌症新发病例的5.7%,死亡782 685例,占全球癌症死亡病例的8.2%,在全球癌症发病率中位居第五,死亡率位居第三,且死亡率和发病率均无下降趋势[1]。由于癌症的异质性,胃癌的表型复杂多样,使得癌症的诊断和治疗更为困难。
微卫星不稳定性是由DNA错配修复受损而导致的一种特殊癌症表型,是基因组中短重复序列超变异性的一种形式,其特征是由于DNA聚合酶滑移和单核苷酸变异(SNVs)频率的升高而导致微卫星重复的广泛长度多态性[2],研究表明,MSI型胃癌约占胃癌患者的15%,这些患者更容易从免疫疗法中获益[3]。MSI型胃癌患者有其独特的临床特征,例如:弥散型癌组织基因组更不稳定、发病部位常见于肿瘤组织远端、肿瘤类型多为Borrmann3型等;MSI型胃癌患者通常具有良好的总体长期预后,与同期的MSS型胃癌患者相比,MSI型胃癌患者生存率较高;且从癌前到发病,MSI逐渐累积增加[4-7]。因此,MSI检测对胃癌的早期诊断和筛查,延长胃癌患者的预后,辅助胃癌治疗的临床决策有重要意义。主流的MSI检测方法主要有两种:免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)和聚合酶链式反应(PCR)[8];IHC是通过检测错配修复基因的表达情况来反应MSI状态,PCR则是通过特定的单核苷酸位点的基因标记进行遗传分析;但无论是IHC还是PCR检测手段均需要在大容量的三级医疗中心进行,且需要较高的经济和时间成本,在临床实践中难以推广至每一个患者[9]。……
