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基于LSTM-SVM模型和SNP遗传信息的帕金森疾病识别问题研究

2021-12-17刘宝民汪健冬郭志佳乔梦茹

电子测试 2021年22期
关键词:特征模型

刘宝民,汪健冬,郭志佳,乔梦茹

(1.鲁东大学物理学院,山东烟台,264025;2.鲁东大学数学与统计科学学院,山东烟台,264025)

0 引言

帕金森病(Parkinson’s disease, PD)是继阿茨海默病之后的第二大类神经系统变性疾病, 常发于中老年人群。目前全球PD患病率约405/10万,预计至2030年我国患病人数将达到494万人[1],因此准确诊断PD越具有重要意义。

国内对于深度学习与帕金森疾病诊断的研究,根据研究的内容,大致可分为两个方面:深度学习在医学影像上的应用,如王洋等人[2],根据卷积神经网络对于MRI图像进行研究、并进行反卷积处理,张巧丽等人[3]使用深度学习方法实现对帕金森疾病、多系统萎缩症和健康人群的诊断;深度学习在患者行为表现方面的识别,如张颖等人[4]提取声纹特征、DNN识别并分类的方法用于区分PD患者和健康人,焦嘉烽[5]提出深度学习与声谱图的帕金森症检测方法,王金甲等人[6]基于卷积神经网络进行特征学习并识别出步态冻结,李彦琳等人[7]设计了一种基于DCNN的步态识别方法,用于PD患者的步态分类和严重程度等级评定。

尽管有了很多卓有成效的研究,但是结合深度学习,在遗传基因方面对于帕金森疾病的研究并不常见,缺乏遗传学角度对帕金森疾病成因的分析。因此,本文在使用LSTM网络提取SNP数据特征的基础上,使用不同的分类器,对于提取后的特征进一步分类,实现对于基因数据在帕金森疾病诊断上的应用。

1 基于LSTM-SVM的SNP数据诊断帕金森疾病模型

1.1 模型概述

首先对于SNP数据进行预处理:质量控制、独热编码、时间序列化处理。……

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