白李唯丹, 戴亮芳, 陈雅玲, 张帆涛, 谢建坤, 罗向东

东乡野生稻苗期响应低温胁迫的转录组分析

白李唯丹, 戴亮芳, 陈雅玲, 张帆涛, 谢建坤, 罗向东*

(江西师范大学 生命科学学院，南昌 330022)

为了解东乡野生稻()对低温胁迫的响应机制，对苗期的RNA-seq转录表达谱进行了研究。结果表明,与对照相比，共检测到10 200个差异表达基因(DEGs)，其中5 201个上调表达，4 999个下调表达，其中有426个DEGs位于已报道的水稻耐冷QTL区间，且37个为耐冷调控相关的家族基因。GO功能分类和KEGG代谢路径分析表明，核酸结合转录因子活性、氨基酸生物合成以及光合作用代谢等均参与响应低温胁迫过程。实时荧光定量分析表明，ABA响应蛋白基因、MYB转录因子和40S核糖体蛋白SA基因等12个可能与低温胁迫响应相关的DEGs表达模式与RNA-seq的一致。可见，植物激素传导途径和转录因子相关调控基因在东乡野生稻苗期响应低温胁迫过程中起重要作用。

东乡野生稻；低温胁迫；转录组学；耐冷基因

水稻()是最重要的粮食作物，其产量约占世界粮食总产量的1/3[1]。然而，随着全球气候变暖，极端天气发生日趋频繁，低温冷害已成为限制水稻安全生产的主要因子[2]。据统计，全世界每年约有1.50×107hm2的水稻在不同生长时期遭受寒害或冷害，轻者导致秧苗黄化，生长迟钝；重者出现烂秧、烂芽或死苗，甚至颗粒无收[3]。我国每年因低温冷害导致水稻减产5.0×109～1.00× 1010kg[2]。因此，研究水稻耐冷机制，挖掘水稻遗传潜能，培育水稻耐冷新品种具有重要的理论和实践意义。

东乡野生稻()是全球分布最北的普通野生稻，蕴藏着强耐冷、抗旱和高产等优异基因。……