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基于生物信息学的睡莲SSR位点特征分析

2021-12-14王凌云李春牛李先民黄展文王虹妍

西南农业学报 2021年10期

苏 群,田 敏,刘 俊,王凌云,李春牛,李先民,黄展文,王虹妍*

(1.广西农业科学院花卉研究所,广西 南宁 530007;2.云南省农业科学院花卉研究所/国家观赏园艺工程技术研究中心,云南 昆明 650200;3.广州市番禺区莲花山旅游区,广东 广州 511400;4.金华市农业科学研究院,浙江 金华 321000)

【研究意义】睡莲为睡莲科(Nymphaeaceae)睡莲属(NymphaeaL.)多年生草本宿根花卉[1],其花朵挺于或浮于水面,香味馥郁芬芳,色彩绚丽而多变,是极好的园林造景素材;花梗和叶梗可作蔬菜食用,且根茎具有良好的净化水质作用[2-3]。蓝星睡莲(N.colorata)具有其他园林花卉中不常见的纯蓝色花瓣,是睡莲育种中蓝色基因亲本的来源之一,且基因组有较小[4];小花睡莲(N.micrantha)叶片具胎生能力,可短时间内繁殖大量个体,是培育胎生品种的重要亲本。但目前有关睡莲分子遗传学和分子生物学及针对睡莲属植物开展特异性分子标记的研究较少[5],在睡莲属植物群体遗传结构分析及分子层面品种鉴定等相关工作严重滞后,睡莲优质种质资源的筛选和后续开发利用进展缓慢。因此,分析蓝星睡莲和小花睡莲叶片转录组测序产生的Unigene及蓝星睡莲全基因组序列的简单重复序列(SSR)位点特征,对睡莲属植物种质资源鉴定、遗传多样性分析及遗传连锁图谱构建均具有重要意义。【前人研究进展】Peter等[6]、苏群等[7]研究发现,ISSR分子标记可应用于睡莲属植物的遗传多样性分析,ISSR分子标记为单引物标记,虽具有较好的种属间通用性,但其特异性相对较差。SSR为共……

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