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445份种质材料全基因组重测序揭示栽培生菜的驯化历程

2021-12-12

中国蔬菜 2021年5期
关键词:分析

生菜是菊科的重要蔬菜,包括叶用的生菜和茎用的莴笋。生菜是由野莴苣驯化而来,叶用的生菜传入中国后渐渐演化成茎用的莴笋,并成为我国的主要栽培类型。随着人们生活习惯的改变,生菜在我国的消费量也呈逐年增加的趋势。生菜也是水培种植的模式作物,是植物工厂中最常种植的作物之一。在植物工厂中,生菜的生长速度、光利用效率、营养吸收利用、产品品质等性状需要通过育种针对性地进行改良。在大田或保护地种植,则急需抗性高、耐高温抽薹的优良品种,以适应全球气候变暖造成的多发反常高温天气。

2021 年4 月12 日,深圳华大生命科学研究院与荷兰瓦赫宁根大学等多家单位合作在Nature Genetics发表了题为“Whole-genome resequencing of 445Lactucaaccessions reveals the domestication history of cultivated lettuce”的研究论文,对囊括了所有生菜栽培类型及主要野生近缘种的全球445 份生菜种质资源展开全基因组重测序工作,全面揭示了栽培生菜的完整驯化进程,并对种质资源结构、重要农艺性状和抗病基因来源进行了探索研究,为生菜育种提供了丰富的数字化资源。

生菜的起源及栽培驯化过程,因缺乏系统的研究证据至今尚未明晰。该研究团队通过系统进化分析发现,所有生菜样品在进化树上聚为一支,揭示了栽培生菜从野莴苣(L.serriola)中的单一起源。对主成分分析和群体结构解析,野莴苣分为6 个具有不同群体特征的地理居群,且栽培生菜与高加索地区、两河流域的野莴苣居群具有最近的遗传距离,由此推断,栽培生菜可能起源于高加索地区、两河流域。……

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