茶树菇复合群菌株内ITS序列异源特征分析
2021-12-11柴红梅赵永昌陈玉惠陈卫民
钱 蓉 柴红梅 赵永昌 陈玉惠 陈卫民
(1. 西南林业大学生命科学学院,云南 昆明 650233;2. 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所,云南 昆明 650221;3. 云南省农业生物技术重点实验室,云南 昆明 650223;4. 农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室,云南 昆明 650223)
茶树菇(Cyclocybe aegerita)是一个包含多个形态学上相似群体的复合种群[1],多生长于柳树或茶树腐朽的枝桠部位。茶树菇作为一种美味的食用类真菌,在东亚地区被广泛种植,为我国的第九大类人工培养食用菌,年产量约50万t[2]。利用ITS和线粒体小亚基(mtSSU rDNA)序列,研究者对我国西南地区的茶树菇复合群进行了系统研究,发现这些菌株显示出高多态性,同时还定义了一个新种C. salicacola[3]。因而,系统分析我国的茶树菇菌株资源非常必要,同时也为种质资源的发掘与利用奠定基础。
以往研究中,茶树菇复合群系统研究多使用线粒体小亚基mtSSU序列[4-7]。研究者从茶树菇中克隆获得了完整的mtSSU序列,并构建了DNA二级结构[8-9]。群体分析显示,mtSSU的V4−6−9区序列能够将田头菇属内不同种很好的区分开来,而同一物种来自于不同菌株中的该区域序列则一致[10]。依据该序列特征,从世界各地收集的菌株被分为3个大的类群[11],而我国西南地区的茶树菇菌株也被分为3个类群[3]。
在真菌中,ITS序列作为最常用的分子标记,常用于物种识别及系统学研究[12-15],然而,ITS序列变异(菌株内或菌株间)直接影响了菌株鉴定和系统学分析[16-30]。对于一些ITS序列高度分化的物种,子代同核体杂交后产生的菌株存在ITS异源的现象[31]。……
