基于Web爬虫技术的电子病历信息聚合工具的开发及验证
2021-12-02刘宏嘉王静黄宇亮李晨光吴昊马文君曹文田张艺宝
刘宏嘉,王静,黄宇亮,李晨光,吴昊,马文君,曹文田,张艺宝
1.北京大学医学部医学技术研究院,北京 100191;2.北京大学肿瘤医院暨北京市肿瘤防治研究所放疗科/恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室,北京 100142;3.浙江大学医学院附属邵逸夫医院,浙江杭州 310202;4.北京大学物理学院,北京 100871
前言
人工智能技术在医学科研和临床工作中得到越来越多的应用[1-4],不仅提高工作效率[5],而且减少了由于主观因素和经验水平导致的质量波动和地域差异[6-7]。对于放射治疗专业而言,除了标准DICOM 格式的医学图像[8-9]、放疗计划[10-11]、剂量分布[12]等常用信息外,病历中记录的其他多模态信息也具有不可替代的数据价值[13-14]。
病历是病人在医院诊断治疗全过程的原始记录,包含首页、病程记录、检查化验结果、医嘱、手术记录、护理记录等。随着医学信息化的逐步推进,病历也从曾经的纸质、光盘等粗放存储演变成医院信息系统(Hospital Information System,HIS)集中管理。但是,相比DICOM 格式的电子数据,HIS系统中存放的病历信息缺乏统一标准,对大数据应用背景下的自动挖掘和分析整理带来挑战[15]。系统提供的有限功能已不能满足科研对于批量查询和聚合分析等“定制化”需求,而市面上又缺乏针对HIS系统开发的数据自动挖掘服务工具,进行数据整合时往往使用传统人工方法进行整理。传统人工整理方法不仅效率低下,而且容易发生遗漏或错误,影响样本量的扩充和数据质量的保障[16]。作为访问权限较低的终端用户,如何在没有医院信息管理部门的配合下,安全、便捷地实现对批量病历信息的自动汇总和分析,在大数据时代背景下对于临床和科研工作具有重要意义。……
