赫氏颗石藻(Emiliania huxleyi)响应病毒感染的microRNA转录组分析
2021-11-27张恩权蔡伟聪李桂玲李健刘静雯
张恩权,蔡伟聪,李桂玲,李健,刘静雯
研究报告
赫氏颗石藻()响应病毒感染的microRNA转录组分析
张恩权,蔡伟聪,李桂玲,李健,刘静雯
集美大学食品与生物工程学院,厦门 361000
海洋颗石藻病毒–宿主互作是影响海洋碳、硫生物地化循环及全球气候变化的重要环节。作为大的双链DNA病毒,颗石藻病毒进化出一种“病毒细胞代谢”模式,通过重编程宿主代谢途径以满足其代谢需求,但对这一代谢模式的调控机制尚缺乏足够的认识。MicroRNA (miRNA)作为一种基因表达调控的重要因子,能够通过调控代谢过程中的靶基因表达,从而调节相关代谢通路。本研究采用small RNA测序技术分析病毒感染颗石藻差异表达的miRNA及其靶基因功能,鉴定出26条成熟miRNA (包括2条病毒来源的miRNA),均来自23条新的miRNA前体序列,其中5条miRNA显著差异表达,包括4条上调,1条下调。实时荧光定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)验证结果与miRNA-seq结果基本一致。功能富集分析显示,5个差异表达的miRNA可能参与调节糖代谢、脂代谢和氨基酸等代谢。此外,差异表达miRNA的表达水平与脂质代谢相关靶基因如、、、、、等的表达水平呈负相关,说明这些miRNA可能在病毒感染过程中对宿主的脂质代谢发挥重要的调控作用。
赫氏颗石藻;颗石藻病毒;small RNA测序;microRNA;脂代谢
海洋颗石藻(Coccolithophores)是一种全球广泛分布且具有重要生态功能的真核微型浮游植物[1~3],其中赫氏颗石藻(, Eh)具有形成“球石粒”和高产二甲基硫化物(DMSP)的能力,且几乎每年都在大洋(尤其是高纬度海域)中形成大面积赤潮[4],该藻赤潮的迅速大规模消亡被证实是特异性病毒(virus, EhV)感染和裂解所致[5,6]。……
