边培培，张禹，姜雨

综 述

泛基因组：高质量参考基因组的新标准

边培培，张禹，姜雨

西北农林科技大学动物科技学院，杨凌 712100

随着三代测序组装的高质量参考基因组的陆续发布，以及大规模重测序和群体遗传学分析的广泛进行，研究人员发现来自单一个体的参考基因组远不能涵盖整个物种的所有遗传序列，大量缺失序列导致群体遗传变异图谱不完整，而构建来自多个个体的泛基因组能很好地解决这一缺陷，其研究内容包括负责基本生物学功能及该物种主要表型特征的核心基因组以及与物种的遗传多样性和个体独特性相关的可变基因组。根据核心和可变基因组所占比例的不同，泛基因组存在开放型和闭合型两种类型。本文主要综述了细菌、真菌和动植物的泛基因组学研究进展，讨论了其在各生物类群中的特征，其中哺乳动物泛基因组是相对闭合的，而目前已知的微生物、被子植物和部分低等动物的泛基因组倾向于开放，通过泛基因组的构建可以完善现有参考基因组并获取整个物种的完整变异信息，将有助于深入研究遗传多样性和表型变异产生的分子机制。

泛基因组；存在/缺失变异；核心基因组；可变基因组

随着功能基因组学对基因功能的研究越来越细致，一个物种是否拥有高质量的参考基因组成为了深入解析其遗传与表型关系的重要前提。然而在群体水平上，研究人员发现来自同一物种不同个体的基因组序列并不能完全与该物种的参考基因组一一对应。……