在洞穴系统的深处，生物的一生都笼罩在黑暗之中。有些鱼，比如盲鲶鱼，甚至进化成完全没有眼睛的鱼。其他的生物，如某些洞穴蜘蛛和蜈蚣，进化出细长的四肢作为感觉器官。这些洞穴生物几乎都是半透明的。这种对黑暗的适应性状被称为洞穴适应性形态。