微滴式数字PCR和实时荧光定量PCR检测大豆中的转基因成分
2021-11-20杨晨邓嘉慧陈佩虹丁清龙陈丹霞周露
杨晨 邓嘉慧 陈佩虹 丁清龙 陈丹霞 周露
(广东省食品检验所 广东广州 510435)
1 前言
截至2018年,转基因作物的商业化种植已持续23年,全球种植面积为1.917亿hm2。其中,转基因大豆的种植面积占50%,耐除草剂大豆GTS40-3-2(抗草甘膦转基因大豆)是获得批准种植的转基因作物转化体[1-3]。我国作为转基因大豆进口大国,对于转基因大豆食品的监管应需要逐步加强。根据《食品安全法》第六十九条规定:“生产经营转基因食品应当按照规定显著标示。”急需稳定可靠、易于推广的定量检测方法[4-6]。
微滴式数字PCR(Droplet Digital PCR,ddPCR)是第三代PCR(Polymerase Chain Reaction)技术,可以实现绝对定量分析。相较于传统PCR及qPCR(Realtime fluorescence quantitative PCR,qPCR),ddPCR可以实现单分子分析,不依赖于扩增曲线的循环阈值(cyclethreshold,Ct)进行定量,且不依赖于扩增效率及标准曲线,已在食品掺假鉴别、转基因成分分析等领域应用[7-9]。但其所用仪器较为昂贵,试剂成本较高,且检测成分复杂、未知成分的食品时,需要耗费较高的成本,一定程度上限制了该技术的应用与推广[10-15]。qPCR也能很好满足常规样品的转基因检测需求,日常检验成本比ddPCR更具有优势。
本文通过ddPCR与qPCR法,对日常大豆样品进行转基因项目检测,旨在比较2种方法的优缺点,为日常样品的转基因成分检测探索多种检测方案,也为其他转基因产品的定量分析提供参考。
2 材料与方法
2.1 实验材料
大豆转基因成分(阴性)样品、GTS-40-3-2品系大豆样品(中国检验检疫科学研究院测试评价中心);市售大豆样品10份。
扩增引物及探针由生工生物工程(上海)股份有限公司负责合成,其序列参考GB/T 33526-2017[16]、GB/T 38132-2019[17]和SN/T 1204-2016[18]。……
