园林树木基因组学研究进展
2021-11-13林授锴林海兰陈璘霞温丽娟林顺权
林授锴,林海兰,陈璘霞,温丽娟,林顺权,3
(1.莆田学院 环境与生物工程学院,福建 莆田 351100;2.莆田市城市园林发展集团有限公司,福建 莆田 351100;3.华南农业大学 园艺学院,广东 广州 510642)
0 引言
园林树木是指适合在园林中栽培应用的木本植物。园林树木多数为具有观赏价值的树种,也包括不以美观见长但具有卫生防护和改善环境等作用的树种[1]。基因组学(genomics)是一门进行生物基因组研究和利用的学科,通过分析基因组DNA序列或其表达产物等来解读基因组信息,对于整合生命科学各学科分支,深化与开拓生命科学新的研究方向具有极其重大的意义[2]。
2000年拟南芥全基因组测序完成并公开,这是第一个基因组被完全测序的植物;2001年人类基因组计划公布了人类基因组草图;2002年水稻基因组测序完成[3]。园林树木的基因组学研究是在人类基因组计划和拟南芥、水稻等模式植物基因组计划取得成功的基础上开展起来的。
木本的模式植物毛果杨(Populus trichocarpa)是园林树木最早完成基因组测序的物种。2006年,Tuskan等测序并组装获得约485 Mb的毛果杨基因组序列,注释蛋白编码基因约45 000个;比对毛果杨(木本植物)和拟南芥(草本植物)基因组发现,有10%的毛果杨基因在拟南芥基因组中没找到对应部分[4]。园林树木在毛果杨测序完成之后有一个间断期,直到2012年我国学者完成了第一个木本花卉植物梅花(Prunus mune)的全基因组测序[5]。随后,学者们又陆续完成了马缨杜鹃(Rhododendron delavayi)[6]、樱花(Prunus yedoensis)[7]、月季(Rosa chinensis)[8]及其近缘种等的基因组测序。……
