基于测序基因分型技术的3种石斛兰遗传关系分析
2021-11-10王趁芳黄守程周玉丽王晓鹏刘爱荣侯北伟叶梅荣
王趁芳,黄守程,周玉丽,王晓鹏,刘爱荣,侯北伟,叶梅荣*
(1.安徽科技学院,安徽凤阳233100;2.南京野生植物综合利用研究所,江苏南京211100)
测序基因分型技术(Genotyping by sequencing,GBS)是基于二代测序技术的简化基因组测序,可以检测大量单核苷酸(Single nucleotide polymor⁃phisms,SNP)变异位点,并且成本低[1]。SNP为第三代分子标记、具有密度高、分布范围广、遗传稳定、分型简单、可自动化等优点[2],SNP多态性是指由于单个核苷酸变异所引起的基因组上DNA序列的多态性[3]。目前GBS-SNP标记已广泛用于动植物群体的进化、育种、亲缘关系、遗传结构、物种鉴定等研究[4]。如周萍萍等[5]利用该标记研究栽培六倍体燕麦(Avena sativaL.)的起源;Talaveraet al.[6]应用该标记研究牛油果(Persea americanaMill.)的遗传多样性和群体结构。
霍山石斛(Dendrobium huoshanenseC.Z.Tang and S.J.Cheng)、铁皮石斛(Dendrobium officinaleKimura et Migo)和 细 茎 石 斛(Dendrobium monili⁃forme(L.)Sw.)均为兰科(Orchidaceae)石斛属(Den⁃drobiumSw.)多年生附生草本植物,是我国传统名贵的药用植物[7]。霍山石斛俗称米斛、霍石斛等,仅分布在我国大别山区,如湖北英山、河南南召、安徽霍山等地区[7];而铁皮石斛和细茎石斛分布范围广泛,从我国云南最南部的热带到北部的河南省均有分布[8-9]。霍山石斛的茎杆加工成的枫斗被称为“金霍斗”,为“枫斗之王”;而铁皮石斛和细茎石斛的茎杆被加工成著名的中药“铁皮枫斗”和“铜皮枫斗”[10-11]。中国约有40多种石斛作为传统的中药药材,具有重要的药用和保健功能,据《神农本草经》记载“石斛,一名林兰。味甘,平,无毒。主伤中,除痹,下气,补五藏虚劳赢瘦,强阴。久服厚肠胃,轻身延年”[12]。现代药理研究表明,石斛具有养胃润肺、清音明目、增强免疫力、抗氧化、抗肿瘤、降血糖、防衰老和延年益寿等功效[13]。……
