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乳腺癌基于蛋白表达的风险预后模型构建和6种关键蛋白的鉴定

2021-11-09梁玉娜

关键词:乳腺癌分析模型

李 健 梁玉娜

泰安市中心医院乳腺疾病诊疗部,山东泰安 271000

乳腺癌现在已经成为女性最常见的癌症。根据Lancet最新的乳腺癌研究综述,乳腺癌的发病率占世界女性癌症的30%,死亡率与发病率的比值为15%[1]。根据以往的研究表明,病理分期对于乳腺癌患者的预后有很大的影响。乳腺癌是一种异质性很强的肿瘤,主要分为4种分子类型:lumial A型、lumial B型、Her-2阳性和三阴性亚型,对乳腺癌的复发和转移具有重要的预测价值[2],但对于同一分子类型以及病理分期的患者,有时预后仍有非常大的差异。

随着测序技术的发展,近年来越来越多的研究表明,虽然多种mRNA、miRNA、lncRNA、ceRNA等基因标志物对乳腺癌的预后有着良好的预测作用[3-5],然而,对于乳腺癌的诊断和治疗仍然缺乏特异的、敏感的生物标志物。蛋白表达在肿瘤发生的不同阶段发挥着关键作用,但目前还没有关于乳腺癌的蛋白预后模型研究。蛋白质水平的研究比RNA水平的研究更有利于临床应用,基于此,本研究拟从蛋白质水平来分析乳腺癌,并且从蛋白质角度来构建多种蛋白质联合预后模型,以期为乳腺癌的临床诊断、治疗及预后的准确性提供重要的参考资料。

1 材料和方法

1.1 数据收集

乳腺癌患者的蛋白质表达谱和匹配的临床信息从癌症蛋白质组图谱门户(TCPA)[6](https://www.tcpaportal.org/tcpa/,包括879个乳腺癌样本和224个蛋白质)和TCGA网站(https://portal.gdc.cancer.gov/,包括901个临床病例信息)分别下载。TCPA是一个综合资源,用于访问、可视化和分析患者肿瘤样本和癌细胞系的功能蛋白质组学。……

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