基于网络药理学与分子对接探究甘草-泽泻药对治疗室性早搏的分子机制
2021-11-08岑崇民唐玉玲
岑崇民 唐玉玲







摘要:目的:探讨甘草-泽泻药对治疗室性早搏(premature ventricular contractions,PVCs)的潜在分子机制。方法:運用中药系统药理学分析平台TCMSP数据库、PubMed数据库、UniProt数据库筛选出甘草-泽泻药对的化合物成分以及靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGKB、DrugBank以及TTD数据库检索PVCs相关靶点,并运用Venny 2.1.0在线获取成分-疾病的交集靶点;采用STRING数据库构建成分-疾病交集靶点基因的蛋白质相互作用关系(PPI)网络并导入Cytoscape3.8.2软件进行拓扑学分析,筛选出每个条件大于中位值的靶点,即核心靶点;使用R语言Bioconductor程序包对成分-疾病共有靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。以核心靶点所编码蛋白为受体、主要有效成分为配体,采用AutoDock Vina 1.1.2软件进行分子对接。结果:共挖掘出甘草-泽泻药对相关靶点206个、PVCs相关靶点3997个,两者共有靶点159个,其中核心靶点共4个。最终富集到GO功能条目2491个,KEGG信号通路186条。将受体与配体进行分子对接,任意两者结合能均低于-7 kcal/mol,有较强的结合活性。结论:甘草-泽泻药对治疗PVCs可能是槲皮素、山柰酚、甘草酮A、柚皮素、甲素通过调控TP53、JUN、MAPK1、MAPK3等核心靶点,作用于IL-17信号通路、TNF信号通路等而实现的。
关键词: 甘草-泽泻药对;室性早搏;网络药理学;分子对接;分子机制
【中图分类号】R28 【文献标识码】A 【文章编号】2107-2306(2021)09--05
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室性早搏又称为室性前期收缩,是一种最常见的心律失常,是指房室束分叉以下部位过早发生提前心室肌除极的心搏。正常人也会引起室性早搏,大部分患者在生活中没有任何临床表现,部分患者可表现出心慌、胸闷、心跳停搏。室性早搏也可以见于一些药物中毒、过量饮酒、电解质紊乱的患者。……
