基于DNA条形码技术对喉红石斛的植物学分类研究
2021-11-08刘红梅张存艳张廷模
中草药 2021年21期
刘红梅,张存艳,叶 强,张廷模,郭 力*
• 药材与资源 •
基于DNA条形码技术对喉红石斛的植物学分类研究
刘红梅1, 2,张存艳1,叶 强1,张廷模1,郭 力1*
1. 成都中医药大学 西南特色中药资源国家重点实验室,四川 成都 611137 2. 电子科技大学,四川省人民医院 药学部(个体化药物治疗四川省重点实验室),四川 成都 611731
利用DNA条形码技术探索喉红石斛的分类归属问题,并建立一种新的ITS2二级结构的信息挖掘方法。提取分属5个组14种石斛的DNA,对ITS序列(ITS1-5.8 S-ITS2)进行PCR扩增,测序,获得ITS序列;基于序列信息,计算遗传距离、构建系统发育树,对ITS2的二级结构进行预测,并对其进行量化、聚类分析。喉红石斛与黑毛组的矮石斛、长距石斛的遗传距离最小,NJ系统发育树与ITS2二级结构的系统聚类图均显示喉红石斛与黑毛组石斛聚为一支,且喉红石斛与黑毛组石斛的二级结构图基本一致。喉红石斛与黑毛组石斛的亲缘关系最近,应归属于黑毛组;新建立的ITS2二级结构量化分析方法可提供更多的分类信息,具有更高水平的分类潜能。这是首次运用DNA条形码进行石斛组间的分类研究,为石斛属植物系统提供了重要依据。
喉红石斛;DNA条形码;ITS;二级结构;分类鉴定
石斛属Sw.是兰科(Orchidaceae)植物中最大的属之一[1],大约有1200~1500种,主要分布于亚洲与澳洲[2],具有良好的药用与观赏价值。自1995年以来,《中国植物志》收载了76种石斛属植物,包括74种石斛和线叶石斛的2个变种,依据形态学分类法被分为12个组[3];自2016年起《中国植物志》网络版新收载了喉红石斛[4],为单列品种,尚未归类。……
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