封口处理对保存在silica膜上的人全血DNA质量的影响
2021-11-08张瑞丽钱云杨静逸
张瑞丽,钱云,杨静逸
(云南舜喜再生医学工程有限公司,云南昆明 650106)
脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleic Acid,DNA)是构成染色体的重要组成部分[1]。基因组DNA中含有生物体所有的遗传信息,随着生物技术的发展以及深入的研究,各种基因工程技术已在医药、农业、畜牧等领域中得到广泛的应用[2-3]。
DNA测序技术在医学遗传学的研究中是必要的手段之一。本实验将DNA置于silica膜中保存不同的时间,通过对比保存不同时间的DNA结构完整性,得出DNA在加水立柱中可保存时间,为DNA长途运输极限时间提供数据支持。
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 实验样本
抗凝全血样使用EDTA二钠抗凝管采集,并置于4 ℃备用。
1.1.2 仪器及试剂
无核酸污染的Tip头、无水乙醇,生工生物工程(上海)股份有限公司;1 kb DNA Ladder(Dye Plus)和6×Loading Buffer,宝日医生物技术(北京)有限公司;UltrapowerTM核酸染料,北京百泰克生物技术有限公司。
MICROCL 17/17R 高速离心机,美国Thermo Scientific公司;VORTEX-GENIE®2漩涡混合器,美国Scientific Industries公司;单道可调精准移液器,美国RAININ®;AxyPrep血基因组DNA试剂盒,江苏康宁;NanoDrop 2000超微量分光光度计,美国Thermo Scientific公司;G:BOX F3凝胶成像系统,美国Syngene公司。
1.2 实验方法
1.2.1 人全血DNA提取方法
采用AxyPrep血基因组DNA试剂盒对采集的血液样本进行DNA提取,在silica膜中央加入100 μL的ddH2O洗脱DNA。
1.2.2 DNA浓度及完整性测定
取1 μL的DNA样本用超微量分光光度计测定其浓度和纯度(A260/A280);取 1 μL的 DNA、0.21 μL的6×Loading Buffer、1 μL的1%核酸染料混合液点样于琼脂糖凝胶进行电泳(1%琼脂糖凝胶,电压120 V,时间40 min),用凝胶成像系统采集图像,检测基因组完整性。
1.2.3 试验设计
分为加封口膜(F)和无封口膜(NF)两组,每组样品分别在24 ℃、相对湿度为54%环境下保存0 d、6 d、10 d、14 d、18 d、20 d、22 d 及 24 d时测定其浓度、完整性及剩余体积,每组设置3个重复,以第0 d作为对照组。……
