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基质辅助激光解析电离飞行时间质谱在结核分枝杆菌耐药检测中的应用价值研究

2021-11-07余艳芳赵开顺屠春林陈娓梁海鹰易清清梁凯轶孙亚蒙

实用心脑肺血管病杂志 2021年10期
关键词:耐药检测

余艳芳,赵开顺,屠春林,陈娓,梁海鹰,易清清,梁凯轶,孙亚蒙

结核病已成为严重危害全球范围内人群健康的公共卫生问题之一,近年来广泛耐药结核病(extensively drug-resistant tuberculosis,XDR-TB)和耐多药结核病(multidrug-resistant tuberculosis,MDR-TB)使结核病的临床治疗困难重重。为了避免结核分枝杆菌发生获得性耐药,WHO建议结核病及疑似结核病患者在行标准抗结核治疗前进行药敏试验[1],以早期发现耐药结核病(drug-resistant tuberculosis,DRTB)。但传统细菌耐药检测手段如表型药物敏感性试验(drug susceptibility test,DST)耗时较长(一般需要3~4周),同时因细菌生长不良或受其他微生物污染影响而导致结果不确定,进而延误患者治疗[2]。

近年随着结核分枝杆菌耐药分子机制的阐明,采用分子生物学技术检测结核分枝杆菌的耐药基因已成为诊断DR-TB的方法[3]。基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF)是美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration,FDA)批准的痕量核酸检测系统,其具有检测时间快、准确度高、成本低等特点[4]。近年随着GridION(Oxofrd Nanopore Technologies)测序平台不断更新,利用纳米孔测序仪获得较大测序深度后得到的校正序列与Sanger测序相比准确率高达100%,且其鉴定微生物及微生物耐药性的费用与Illumina二代测序相当,但测序时间极大缩短了[5-6]。本研究以最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)法为药敏试验的“金标准”,以三代测序验证突变基因,旨在分析MALDI-TOF在结核分枝杆菌耐药检测中的应用价值,以期为DR-TB防控方案的制定提供一定理论基础。

1 材料与方法

1.1 菌株来源 收集2016—2020年上海市嘉定区中心医院肺科诊治的200例复治肺结核患者的痰液标本,其中男性157例,女性43例;……

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