基于SWChen 系统预测靶向林麝(Moschus berezovskii) FASN、HMGCR 和CYP11A1基因miRNAs的研究*
2021-11-05谌颖莲曾德军赵贵军封孝兰张承露吴佳勇
谌颖莲,曾德军,赵贵军,封孝兰,张承露,吴佳勇,竭 航
(重庆市药物种植研究所,特色生物资源研究与利用川渝共建重点实验室,重庆 408435)
麝香是一种珍贵的动物源药材,具有较高的药用价值和香料价值[1-4],但其形成过程复杂且未知,限制了麝香产业的发展和产香效率的提高。研究表明:麝香的化学组分包括脂肪酸类的烷烃物质或衍生的醇类、酮类和醛类 (如麝香酮、6-甲基庚烷-1,6-二醇和十六烯醛等)以及固醇类、甾类和芳香族类物质 (如胆固醇、间甲酚和二氢雌甾酮等)[2],这些化学组分对麝香形成至关重要,同时也是麝香药用和香用价值的关键物质。动物的脂肪酸合酶(fatty acid synthase,FASN)、3-羟基-3-甲基-戊二酰辅酶A 还原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductase,HMGCR)和细胞色素P450 家族11 亚家族A1 (CYP11A1)是长链的脂肪酸类衍生物、大环碳链酮类以及芳香族甾类物质合成的关键酶[5-9]。基于麝香的化学组分和合成相关化学组成的关键酶,在林麝(Moschus berezovskii)中筛选调控FASN、HMGCR和CYP-11A1基因表达的调控因子,对探究麝香可能的生物合成机制具有重要意义。
MicroRNA (miRNA)是一种长度约为20 nt的非编码RNA,通过作用靶基因mRNA的3′-UTR 在转录后水平抑制靶基因的表达,对动物的生长和代谢等过程具有关键的调控作用[10-11]。筛选调控林麝FASN、HMGCR和CYP11A1基因表达的miRNAs 能够进一步了解麝香的生物合成过程,然而现在已知的林麝基因序列信息非常少,缺少林麝基因的mRNA 和miRNA 序列信息[1,12]。由于牛(Bos taurus)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)与林麝编码基因的3′-UTR 序列并不完全一致,通过同源物种来推测调控林麝基因的miRNAs 获取信息并不完整,缺少适合预测林麝miRNAs的工具。……
