冯伟，宗炜，鞠少卿

(南通大学附属医院医学检验科，江苏南通 226001)

胃癌(gastric cancer, GC)是起源于胃粘膜上皮的恶性肿瘤，死亡率位于全球恶性肿瘤的第三位[1]。GC的发生、发展是一个多阶段、多因素的病理过程[2]。临床诊断主要依靠影像学检查、病理活检以及血清标志物检测，但早期胃癌诊断的阳性率较低，易造成漏诊、误诊。近年来研究表明，包括GC在内的许多肿瘤组织中存在大量的非编码RNA，其中关于LncRNA、miRNA和mRNA研究最为丰富[3]。ceRNA假说最早是由Salmena等[4]提出，其认为任何含有miRNA反应元件(miRNA response elements，MREs)的基因都可以通过MRES与miRNA结合，从而影响其转录表达。LncRNAs广泛分布于真核细胞中，具有多种MREs，能够竞争性结合miRNAs。因此，深入挖掘胃癌中“LncRNA-miRNA-mRNA”的ceRNA调控网络，为胃癌诊治提供新的依据和靶点，具有巨大的临床应用价值和广泛的前景。

本研究拟联合TCGA和GEO数据库进行基因筛选，挖掘胃癌中差异表达的LncRNAs、miRNAs以及mRNAs，构建ceRNA调控网络；利用DAVID数据库对ceRNA调控网络中的差异mRNAs进行GO分析以及KEGG分析，探究差异基因在胃癌发生、发展中的潜在调节机制；利用荧光定量PCR对部分差异基因进行临床标本验证。

1 资料与方法

1.1数据下载 利用TCGA数据库(https://portal.gdc.cancer.gov/)下载人类胃癌的RNA-Seq和miRNA-Seq的Count数据，其中包含343例胃癌组织样本和30例胃正常组织样本；利用GEO数据库(https://www.ncbi.nih.gov/geo/)下载GSE93415数据集的miRNA芯片数据，其中包含20对胃癌组织样本和癌旁组织样本。

1.2差异基因筛选 利用edgeR函数包对TCGA数据整理分析，筛选并确定差异表达的LncRNAs、mRNAs和miRNAs；利用limma函数包对GEO数据整理分析，筛选并确定差异表达的miRNAs。差异基因筛选条件：(1)对……