用Ion Torrent半导体测序技术对血友病B家系F9基因行突变分析及产前诊断
2021-10-28刘安马定远刘刚林颖李璃许争峰钟天鹰
刘安,马定远,刘刚,林颖,李璃,许争峰,钟天鹰
(南京医科大学附属妇产医院&南京市妇幼保健院a.产前诊断中心,b.检验科,南京210004)
血友病B(hemophilia B, HB)是一种X连锁隐性遗传性出血性疾病,其发病机制为凝血因子Ⅸ(coagulation factor Ⅸ, FⅨ)的编码基因F9缺陷所导致的凝血功能障碍[1]。在男性人群中HB的发病率为1/30 000;女性血友病患者罕见,通常为携带者[2]。根据症状的轻重及凝血因子Ⅸ活性(factor Ⅸ coagulant activity, FⅨ:C),临床上将HB分为轻型(FⅨ:C 5%~40%)、中型(FⅨ:C 1%~5%)和重型(FⅨ:C<1%)。HB的主要表现为出血,出血部位为皮肤黏膜、关节、肌肉及深部组织器官,可危及生命[3]。目前临床上尚无有效的根治方法,患者主要以输注FⅨ制剂或新鲜全血的替代治疗为主。因此,开展F9基因诊断、携带者筛查及产前诊断具有重要的临床应用价值[1,3]。本研究应用Ion Torrent半导体测序技术对11个HB家系进行F9基因突变分析,以期明确遗传病因,为进一步指导妊娠提供实验依据。
1 材料与方法
1.1研究对象 收集2014年2月至2018年10月于南京市妇幼保健院遗传咨询及产前诊断门诊就诊的11个HB家系,其中家系3有3例患者。13例患者在本院或者外院诊断为HB,其中11例患者在本院进行了基因诊断,其余2例患者在外院进行基因诊断。对11个家系中的女性成员进行携带者筛查,并为7个家庭提供了产前诊断。家系成员非近亲结婚,染色体核型和微阵列检测未发现染色体结构异常或拷贝数变异,并对其进行Ion Torrent半导体测序检测以寻找致病基因及位点。本研究获得南京市妇幼保健院医学伦理委员会批准(宁妇伦字[2019]-KY086),患者本人或患儿家属均签署知情同意书。
1.2主要仪器及试剂 Lab-Aid 820核酸提取仪(厦门致善公司),ABI A3500Dx基因分析仪(美国Applied Biosystems公司)。血液DNA提取试剂盒(美国Omega公司),Lab-Aid核酸(DNA)分离试剂盒(厦门致善公司),21-三体和性染色体多倍体检测试剂盒(广州达安基因公司)。Ion AmpliSeq Library Kit 2.0试剂盒、Ion PGM Sequencing 200试剂盒、Ion OneTouch系统、Ion Torrent 316芯片及Ion Torrent PGM测序仪均由美国Life technologies 公司提供,Sanger测序试剂和配套仪器由美国Applied Biosystems公司提供,PCR扩增试剂购自南京诺唯赞公司,SALSA mLPAPO95染色体非整倍体检测试剂盒(荷兰MRC Holland公司)。……
