APP下载

基于基因表达数据库分析EZH2基因在乳腺癌中的表达及其临床意义

2021-10-21张宝贵天津市静海区医院普外科天津301600

吉林医学 2021年10期
关键词:乳腺癌数据库分析

张宝贵 (天津市静海区医院普外科,天津 301600)

乳腺癌(breast cancer)在女性发病率为第一位,新进的流行病学研究显示,2019年全美预计乳腺癌新发病例271 270例,当年因乳腺癌死亡人数为42 260例[1]。乳腺癌已成为导致女性死亡的重要原因。我国肿瘤流行病数据显示2015年乳腺癌新发病例272 400,死亡人数为707 000例[2]。从数据中可以看出,我国乳腺癌患者预后差于欧美等发达国家。

Zeste同源物2增强子EZH2基因定位于人7染色体q36.1,全长为7 693 bp,编码蛋白为多梳蛋白复合体PcG (Polycomb group)家族重要成员之一[3]。EZH2编码蛋白为赖氨酸N-甲基转移酶(酶代码EC2.1.1.43),参与组蛋白甲基化,为重要的基因表达调控因子。在本研究中,笔者通过多个数据库对乳腺癌EZH2基因表达的临床意义进行了分析,探讨EZH2表达与患者预后的关系,并分析了其共表达蛋白网络,为EZH2靶向调控乳腺癌的生物学功能及临床靶向药物研发提供依据。

1 资料与方法

1.1数据库选择:分别选择肿瘤基因表达芯片数据库Oncomie(https://www.oncomine.org/),生存分析数据库Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/)和蛋白-蛋白相互作用String数据库(https://string-db.org/cgi/input.pl)对EZH2基因表达情况及其临床意义进行分析。

1.2Oncomine,Kaplan-Meier Plotter和String数据库挖掘

1.2.1Oncomine数据库分析:首先对Oncomie数据库EZH2基因检索,初步评估EZH2基因mRNA在多种肿瘤组织中的表达情况(高表达或低表达),然后选择乳腺癌进行数据挖掘。数据挖掘条件为:①肿瘤类型:乳腺癌;②标本类型:手术切除标本;③组织对比:乳腺癌vs 正常乳腺组织;④数据类型:mRNA;⑤显著性:P<1E-4;⑥差异表达级别:大于2倍;⑦基因排序:前10%。

1.2.2Kaplan-Meier Plotter数据库生存分析:检索该数据库中乳腺癌EZH2 mRNA预后数据,选择总生存期和无疾病进展生存期进行分析。根据EZH2 mRNA中位表达水平分为高表达和低表达组,进行比较。……

登录APP查看全文

猜你喜欢

乳腺癌数据库分析
绝经了,是否就离乳腺癌越来越远呢?
隐蔽失效适航要求符合性验证分析
乳腺癌是吃出来的吗
胸大更容易得乳腺癌吗
电力系统不平衡分析
别逗了,乳腺癌可不分男女老少!
数据库
电力系统及其自动化发展趋势分析
数据库
数据库