禹保军，邓占钊，辛国省，蔡正云，顾亚玲，张娟

静原鸡肌肉组织肌苷酸特异性沉积相关LNC_003828- gga-miR-107-3p-MINPP1的关联分析

1宁夏大学农学院，银川 750021；2彭阳县畜牧技术推广服务中心，宁夏固原 756000；3宁夏大学生命科学学院/宁夏饲料工程技术研究中心，银川 750021

【】探究静原鸡肌肉组织肌苷酸沉积过程中关键调控因子的调节作用，利用lncRNA-miRNA-mRNA关联分析鉴定与肌苷酸特异性沉积相关的LNC_003828、gga-miR-107-3p和MINPP1，其作为肉质研究的候选基因，为分子辅助育种提高肌肉品质提供理论基础。测定15只静原鸡胸肌和腿肌的肌苷酸含量，筛选高肌苷酸含量的胸肌和低肌苷酸含量的腿肌各3个样本提取总RNA，质量检测合格后构建cDNA文库、PCR扩增，利用Agilent 2100对文库质量进行评价，库检合格后送Illumina-Hiseq平台进行转录组测序。利用生物信息学方法筛选出静原鸡肌肉组织不同部位差异表达的MINPP1、gga-miR-107-3p和LNC_003828，进行GO注释和蛋白互作网络分析MINPP1的功能。采用qRT-PCR方法检测LNC_003828、gga-miR-107-3p和MINPP1在静原鸡胸肌和腿肌组织中的表达情况，并分析其与肌苷酸含量的相关性。测序样品间基因表达水平相关性2＞0.9，即试验样本之间基因表达可用于后续的差异基因分析。参与肌苷酸合成和代谢的糖酵解/糖异生途径中检测出3个差异表达基因MINPP1、PKM和ALDH9A1。互作分析发现lncRNA-miRNA-mRNA网络图中共有17个miRNA（9个上调，8个下调）、44个mRNA（16个上调，28个下调）和155个lncRNA（68个上调、87个下调），核心节点gga-miR-107-3p互作的靶基因有MINPP1、靶lncRNA有LNC_003828。GO富集分析发现MINPP1基因具有磷酸酶活性、双磷酸甘油酸酯磷酸酶活性等功能；蛋白互作网络中MINPP1基因与参与糖酵解/糖异生和氨基酸生物合成通路中的PGAM1、ENO1、BPGM基因均有互作关系。……