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水产动物基因组近交分析软件的开发和应用

2021-10-18栾培贤张晓峰户国

水产学杂志 2021年4期
关键词:分析

栾培贤,张晓峰,户国

(中国水产科学研究院黑龙江水产研究所,黑龙江 哈尔滨 150070)

水产动物遗传资源是渔业生产和可持续发展的基础,也是满足未来不可预见需求的重要基因库。因此,世界主要国家均极为重视水产动物遗传资源的保护。在制定保护计划过程中,为使有限的人、财、物力发挥更好的效果,需要对保护的资源进行选择,区别需要保护的紧迫性和重要性,客观地评价物种及地理居群受威胁的状况[1]。受自然环境变迁及水利工程、过度捕捞、外来物种入侵等人类活动影响,我国东北、西北、西南等广大内陆地区自然水域以鱼类为代表的水产动物遗传资源都趋于衰退[2]。

一般说来,水产动物自然群体或小规模保种群体会发生小群体近交、个体生殖策略改变、个体小型化等情况,导致基因组某些位点的等位基因频率改变或者丢失,非等位基因组合发生显著变化[3]。这些基因组核苷酸水平的微小变化会体现在个体间亲缘系数改变,体质量、体型以及适应性等重要经济性状的加性效应和非加性效应方差组分变化[4]。有鉴于此,研发高效易行的水产动物基因组近交分析方法并在水生野生动物保护实践中应用,已成为保护遗传学和水产生物技术领域共同关心的重要问题之一。

本研究用高通量的SNP 分子标记替代传统家养群体中的系谱记录信息,拟开发精准快速的软件工具包,在无系谱信息鱼类的野生自然群体或捕获……

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