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盐胁迫下秋茄根系转录组的De novo 测序及分析

2021-10-17邢建宏

关键词:数据库植物

邢建宏,陈 伟

(1.三明学院资源与化工学院/ 福建省资源环境监测与可持续经营利用重点实验室,福建 三明 365004;2.福建农林大学生命科学学院,福建 福州 350012)

近年来土壤盐碱化问题日益突出,对农业可持续发展造成重大威胁[1].因此,深入研究植物的耐盐机理,挖掘耐盐基因资源对改变日趋严重的土壤盐碱化问题有重要意义.红树植物生长在潮间海岸带,受海水的周期性浸渍,形成了一套有别于淡水植物或陆生植物的耐盐机制[2],值得深入研究,并挖掘其中有价值的基因资源.Ilumina 高通量测序技术的出现,为从基因组和转录组层面深入解析植物耐盐分子机理提供了有力手段.近年来研究者利用高通量测序技术对红树(Rhizophora apiculata)[3]和木榄(Bruguiera gymnorrhiza)[4]进行转录组分析,结果表明抗逆基因的表达可能是提高其抗极端环境能力的关键因素.对泌盐红树植物海榄雌(Avicennia officinalis)盐胁迫下根系的RNA-seq 分析表明,ABA 和乙烯介导的植物激素信号通路在其响应盐胁迫中发挥重要作用[5].这些研究为从转录组层面揭示红树植物耐盐机理提供了前期探索,但对非泌盐植物根系的耐盐分子调控机制还未见系统和深入的研究.秋茄(Kandelia candel)是红树植物中典型的非泌盐植物[6],其耐盐能力通过自身基因表达调控实现,蕴藏着丰富的耐盐基因资源,因此从分子水平解析秋茄的耐盐机理可为揭示木本植物耐盐机制提供新的证据.本研究利用Illumina HiSeqTM2000 平台对不同浓度NaCl 处理下秋茄幼苗根系转录组进行测序,并……

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